RNA id: TCONS_00010114



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00010114
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_005258
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 16572195 ~ 16572309 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TgaagcagctagctctctgcaactcttacatggtcgccGACTGACATCAAGCAGGGCtacgcctggtcagtacctggatgggagatcacatgggaaagctaggttgctgccagaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183064

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00010110 lncRNA downstream 120014 16446820 ~ 16452181 (-) True XLOC_005254
TCONS_00010109 lncRNA downstream 124803 16446239 ~ 16447392 (-) False XLOC_005254
TCONS_00010106 lncRNA downstream 124923 16446228 ~ 16447272 (-) False XLOC_005254
TCONS_00010107 lncRNA downstream 124925 16446230 ~ 16447270 (-) False XLOC_005254
TCONS_00011111 lncRNA downstream 712326 15857732 ~ 15859869 (-) True XLOC_005250
TCONS_00011112 lncRNA upstream 170743 16743052 ~ 16746547 (-) False XLOC_005265
TCONS_00011113 lncRNA upstream 366499 16938808 ~ 16951646 (-) True XLOC_005271
TCONS_00010804 lncRNA upstream 369895 16942204 ~ 16943248 (-) True XLOC_005272
TCONS_00011114 lncRNA upstream 392347 16964656 ~ 16966808 (-) False XLOC_005273
TCONS_00011115 lncRNA upstream 392795 16965104 ~ 16966735 (-) True XLOC_005273
TCONS_00010113 mRNA downstream 14089 16555603 ~ 16558106 (-) True XLOC_005257
TCONS_00010112 mRNA downstream 47468 16522472 ~ 16524727 (-) True XLOC_005256
TCONS_00010108 mRNA downstream 119995 16446230 ~ 16452200 (-) False XLOC_005254
TCONS_00010102 mRNA downstream 137045 16405598 ~ 16435150 (-) False XLOC_005253
TCONS_00010099 mRNA downstream 191234 16332416 ~ 16380961 (-) False XLOC_005252
TCONS_00010115 mRNA upstream 20099 16592408 ~ 16595177 (-) False XLOC_005259
TCONS_00010116 mRNA upstream 20266 16592575 ~ 16595406 (-) True XLOC_005259
TCONS_00010118 mRNA upstream 44829 16617138 ~ 16619757 (-) False XLOC_005261
TCONS_00010119 mRNA upstream 44831 16617140 ~ 16619449 (-) True XLOC_005261
TCONS_00010120 mRNA upstream 62133 16634442 ~ 16636627 (-) True XLOC_005262
TCONS_00010111 other downstream 78727 16493352 ~ 16493468 (-) True XLOC_005255
TCONS_00010104 other downstream 137357 16415810 ~ 16434838 (-) False XLOC_005253
TCONS_00010105 other downstream 137360 16431816 ~ 16434835 (-) True XLOC_005253
TCONS_00010103 other downstream 155438 16408308 ~ 16416757 (-) False XLOC_005253
TCONS_00010097 other downstream 987663 15581320 ~ 15584532 (-) True XLOC_005249
TCONS_00010117 other upstream 26434 16598743 ~ 16598857 (-) True XLOC_005260
TCONS_00010121 other upstream 82372 16654681 ~ 16654795 (-) True XLOC_005263
TCONS_00010126 other upstream 170743 16743052 ~ 16746316 (-) False XLOC_005265
TCONS_00010127 other upstream 170973 16743282 ~ 16746547 (-) True XLOC_005265
TCONS_00010131 other upstream 329336 16901645 ~ 16901759 (-) True XLOC_005269