RNA id: TU36573


Basic Information

Item Value
RNA id TU36573
length 6515
lncRNA type inter_gene
GC content 0.37
exon number 3
gene id G24553
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056702.1
NCBI id CM032071.1
chromosome length 29200999
location 75388 ~ 82523 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

GAAAAAAATTTATTGATttggcaaaaatatttaatagtaaatctGAATATATTACATCAGGTAGCCCACATCAATCATGAATACTTAAAGGTGTGTACTGCATCAATGTACAATAAAGGAACCGCTTCAGGAGAACGTCAAGCAGCAAAACCTGAATAAACTTGAGCTGTAAACAAGCTGCAATGCTCTGggctacaaaaacacaaaaaactacaaaatacacAAGTGTACCGATTTCTGTAAGATTTGAAAGGCAAAAACGGACTTACCTCTCAGTCCGGATGTTTATGAGGGAACAGGAACCCACAATATCGATGTCTGTCCTCTTCACTAGCAGAGGATGCGGTTTGAAGAACCACTAGAATTACTCCAATGAACTTGCTCTAACTACAGTGATACACCATCAAACACAGCAATAGAAAGCCCACAGGCTCAGGCAGATAACTGAGCTCACGTGAACCTTAATCTTTCATTCAAACAGATGCAAAGTGACCGATGCACAGGTCATGTGTCCAATACCCAGAAGTACATCTCTCAAATgtctcaaaataaagtgcatgaatatttacagtaagcAGAGATCATCTTACAGACGTGCAAGTGGAAACACTGCTTATTACATCACTAGAAAAACAGCTGCGTAAGCAGTCTACATAAAAATTGGAAACTGCACAATGAATTAGAACAAATTCctattaaaacttaaaaggaATAGGGTCACAAATGTGCTTAATTTACTCCCCCCTCAGAGCatccaaaatgtattaaatgtttgtttctttatcagatttagagaaatgtagcgTTCAATCACTTGCTCACCGGTGAATGTGTGCAGTCAGAAAGAACCTCTAAACAGCTGAGGATTCACAGGTGACAAAATGATGCTAGATTTCTCCATatgattaagaaaaaaacactccTCTACATCTTGGAAGGCTTGAGGACGGATATATtctcattttgggtgaactattccttcaaatTTTAACTATATCAGAATCAAACAAGAGACCTTTTGAGAGACATTGCAGTAAatcctacaaacacacaaagactTGGTATGTACACAAAACAAAGCAGGGACGTCTGCTAGACATTAGAAACGCAGGATATTTTGCTCTATAATTTCCTAGCCATAAAAGATTCATTATTTTGACAAACTACAAATTGAGCACGGTTTCACAGATTTGAAttgcacagctccaatcacaGTCATGAAATCCAATAAACTATGACAAATCAACCCTGCAGGAAGTGGCAATTAATTTGGAATGAACAGGAATTAAAACAGATTGTGCTCAATCTCTTAAAATTAACCCAAATTGGACAAGGCACAATGTTTATAGAAAGATGTCAAACAACCTGAAAGGCATCTCAAACCAATTATTCTGATATCCAAGCAGGAcaagttgaaaataaatgtatgcaattctgaacaaataaaaagcaatgtCTAGCTAAATGTTCAACCCAGTAACCTAAACTAGCAGATCAAGTATGAACAAGCAACAAGTACACACTTTATTACAACACAGATTCTATTTAATAATCAAGGCAAAAAGACACTTACAAACATTATATGGacgaggggaaaaaaagggaagaaacatgaaaccaaaaaaagaaaagaaaaaaaaaaaaatcctataaaaacaaatctagCTAACTGACCATTTACAACATTATAGCAGTGGGaaagttgttttgtgtttcGAACAAGCAGGCAAATAATTCTTTCGCTGAACTGACTTTAGCACACAGCTACTTCcaaataaaactcaaaaataaaaagagctgTTGGGAATTAAGAGTgagtatataatattttacagaacTCTACTTCAGCACTGCAGAGTGTGTCCGGAGTCCGGCGTTCTCCGTGACGGTGCGATGCGGGACGCTGTCGGATGAATCCATGTTGCTCCTGacgtctctcctcctcctcttgcGTTCAGCTGAAAGGTGTCAAAACGAAGGTGGCAGTTTGTTTTGGGGCACAGAacccagaaacacacacagctgcttTTCCCCTCTACATCTACACACGCTCAGACCGTCCCAGACATACACAGGCATGCAAACAACTTCTCAACAGCATCAAACTAAGGGGCATAGAGTAACGACTACTGTAAAAGActaaagcaatatttaaaatgttgtcgTTTCACAAAAGCACAGAATTTGGTAAAAAAGTACAACATTAACTGCAGTCATTAAAACGACCACTGTATTTGAACCAAGCCCCTGGATTCAGTGGATAAATACAGTGTAAAGAGACGACAATCATAAAAAGACATTGGCATGCACAACTATGAAACACTGTACTCAACACCACAACTCTGCAAATACGTCATTTTCACTCTGAAGGACAAAAAGAACTAGTTTAACCAGGAATGAAAGAGTTTGTCCAATATGTAgagtttagtttttaaatcagGTTTGGAGAAACGTAGCTTTCCATCACTCGCTcagcaatggatcctctgcagtgaaTGACGCTACATtcctccagatctgatgaagaaaactCAACCACATCATGAATGGCTTAAAAGTGAACATTGAGCAAATGCTCATTTCTGGAtgaaccatttctttaaaatcatcATTAGCAATTAATCATGTCTGACGTCTAATATTCATCCATGACAATGATAAATGTATAGTATTCACAATACCCACATCAAAAACTGTAATTCACGAGTTGACCAATTGGCAAAGTATGCATTAATAGATTCATATGAAAATAGGTGGCTTTTAGTCCCATTGAGAAATCAACCAACCaaaacaaattcatacaaatcaGCATCTGTATTAAAGGTACATTTTAATCAAAGTTCAAAACAAATTGATACAGGTTGCAACAAGATGAGAggataaaaaatttaatattgaaGATGAAAAACCGCAATTCATTGCAGTGAAGTACAGAAAAAGTGCATGCATGAGCTGGATCTGTAGAAGAAGAGGTTATGGACATTAACTGCATAAAACTCCCTATATTATGATACTGATCGACATTGTTTTGGTTGATTGGTTTATCTCAATGTAAAACATGTACGATATCTTGTGGCATCAAACAAGGTTAACTAGCAATTATtttgagtttagttttttttctattcaataTCACAGTTAAATCTCAATTATATAAGCAGATGCGATTActtaatctgtttattttgtaaacgtCATCTCTTTATCTTATGGAACACCACATCTAAAAGGTTTCACGTCGAAAAATTAATGCTTCAGTCATGGACAAGTCCACATAATAAACTGCGAgatacagacatttaaaaaacacattttatgttggcttttactgaattaaaattcTTTTAGTGCATTTAACTAGTTATTCAGCttcaattaaacaaattagAAACGCTAATgtgcattctttttttctacaacaggaaaaaaaacaaacaaaaaacacttaactCTTAATATTTCCCCCATAGTGTCCACTTTACCTCTGAGAACAAgcatcaaatcaatatttcagaTTTGGTCCACTCCCATTGCTAAAAGCATCCGTTTAATTGTTTACCATTTCATGCATCAGTTCTACTGAGCAAATGAAACGTCTAAGAGTtcaagaaaaggaagaaaagttTAAATTGCTTGATTCTAGTGATTCAGTGGACACTAGAGTTACAGTACACAGGGTTGGACAAAATTCAGCGACTAATAGTACTTTGCCCTTCTGCCGGTCAAGAAAGATAGACAACACAAAAAGTACTGAAGACGTGGtttgttattaaaacattagATTGTGTCTTAAGTCATTTATAGGTGTTTCAGCCCATTTTAGTACaagatctttcagaaataattagcAAGTTAGACATTAACATACAGCTTCTTACGCTGAATTTGTTAACGGTGTAGTTTGTGTttggaattaaaataatactagTACTACTAATACTAGTaacacactcacaaaaacaAGTTTGTCCAATCCTGTGACAACATCTTATAGAAGCACAATACTGAACAGAGGAAAAGGGCTGCGATTAATACCACGTGAGGACCATTACTTCAGAAAAACCTGCACAAATAACCTGGAAACACAGTCATTTCTGCAGATGCATTCAAGACAGAGACACTACATCCAAAAATCCCAATAAATCCCACAAAACAGGGCTCTAACGCAATGGTTTGCAGTGGTTAAGAGCTATTCAAAATTTCTAACCAGATGCATACTTTAAAAGTGCAACAATTTCTGAGTTAATAACAGCGGAACAAAATTGCAAATTGTGCATTGCTGACTTTCCCTGAATGGTGTTACTGCAATTATAGGTTGTACAATTgagaacacagaaaaacaaaaataaaacaaaacacctgAATAAATGGCAGTTTTTTGATAAGAGGCCAGAACAACAATTTGGAGGCTACCAGAATTACATTCAACAAAACTAACAAAGTTGGGCATTTACAATCTATCTGCTAAACCGGAGTTACGGTTTTCATCTAAATCTAGAATATGTGGGGTCACTCACAATGCATCACACACGATATTACAGTGTCCTCAGCATTTACATACAAATTATgcacaaatttacatttaaatacaaatttagcCTGTAGGAACACCATCACACAGCAGAGCCATGAGGTAACAGTAAAACGAGTCTAAAAATCAGACCAACAGGGTTTGAACTGAGGACATGTGctgcattaatttaaatactgattgtgaaaatatttattaaatatgctgcattttaaaaatcacaaacatgagtgtaaaaaaacagtgttaaaaaagctaaaaatgttcACATGTCTCTGGAAAAGCAATATAGCAGTTCTTCTCCATTTGTTTAGCATTaaagtaaatgataaaatgaaaagcaaaactgGTTTAACTGACATTGTAGATCTacctttattttaacatttaacgccataaacaaaaaaatagtgaaGAACTGCTACATGTGCAGCATCTAAGAGGTCGTAAcattaaatatggaaaataa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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU36582 lncRNA upstream 49492 24544 ~ 25896 (+) True G24558
TU36576 lncRNA downstream 2712 85235 ~ 86588 (+) True G24554
TU36595 lncRNA downstream 33676 116199 ~ 116891 (+) True G24567
TU36599 lncRNA downstream 108869 191392 ~ 194183 (+) True cmah
TU36619 lncRNA downstream 133452 215975 ~ 281984 (+) False G24586
TU36621 lncRNA downstream 160043 242566 ~ 282841 (+) True G24587
XM_043237891.1 mRNA upstream 57484 13818 ~ 17904 (+) True LOC122343428
XM_043237890.1 mRNA upstream 62270 9542 ~ 13118 (+) True LOC122343427
XM_043236240.1 mRNA downstream 4481 87004 ~ 89152 (+) False yeats4
XM_043236239.1 mRNA downstream 4503 87026 ~ 89152 (+) True yeats4
XM_043236241.1 mRNA downstream 4503 87026 ~ 89152 (+) False yeats4
XM_043237828.1 mRNA downstream 7685 90208 ~ 107305 (+) True frs2a
XM_043236793.1 mRNA downstream 102193 184716 ~ 193483 (+) False cmah
TU36577 other downstream 1165 83688 ~ 84962 (+) True G24555
TU36656 other downstream 210712 293235 ~ 295069 (+) True G24609
TU36680 other downstream 291004 373527 ~ 373824 (+) False G24632
TU36683 other downstream 291004 373527 ~ 374082 (+) True G24632
TU36860 other downstream 571569 654092 ~ 665530 (+) True G24771

Expression Profile