RNA id: XM_043239081.1


Basic Information

Item Value
RNA id XM_043239081.1
length 10705
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 8
gene id si:ch211-284e13.4
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 14064549 ~ 14086478 (-)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome
species tiger barb
(Puntius tetrazona)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU53602 lncRNA downstream 87479 13975352 ~ 13977070 (-) False G36385
TU53605 lncRNA downstream 87479 13975352 ~ 13977070 (-) True G36385
TU53610 lncRNA downstream 87479 13975352 ~ 13977070 (-) False G36385
TU53531 lncRNA downstream 245215 13818248 ~ 13819334 (-) True G36337
TU53473 lncRNA downstream 351129 13712680 ~ 13713420 (-) True G36297
TU53878 lncRNA upstream 189620 14276096 ~ 14310067 (-) True G36541
TU53857 lncRNA upstream 193198 14279674 ~ 14282516 (-) True znhit1
TU53914 lncRNA upstream 224148 14310624 ~ 14310860 (-) True G36561
TU53915 lncRNA upstream 224486 14310962 ~ 14311328 (-) True G36562
TU53864 lncRNA upstream 225292 14311768 ~ 14320994 (-) True G36537
XM_043238794.1 mRNA downstream 7844 14040982 ~ 14056705 (-) False rnf214
XM_043238793.1 mRNA downstream 7844 14046950 ~ 14056705 (-) False rnf214
XM_043238788.1 mRNA downstream 7844 14046950 ~ 14056705 (-) False rnf214
XM_043238789.1 mRNA downstream 7844 14046950 ~ 14056705 (-) False rnf214
XM_043238792.1 mRNA downstream 8595 14046950 ~ 14055954 (-) False rnf214
XM_043239096.1 mRNA upstream 2669 14089145 ~ 14094042 (-) False LOC122345200
XM_043239095.1 mRNA upstream 5490 14091966 ~ 14094019 (-) True LOC122345200
XM_043239094.1 mRNA upstream 8102 14094578 ~ 14099813 (-) True si:ch211-284e13.6
XM_043239084.1 mRNA upstream 14016 14100492 ~ 14112076 (-) False gucy2d
XM_043239083.1 mRNA upstream 14016 14100492 ~ 14112076 (-) True gucy2d
XR_006250968.1 other downstream 7844 14045477 ~ 14056705 (-) False rnf214
XR_006250967.1 other downstream 7844 14045477 ~ 14056705 (-) True rnf214
XR_006251003.1 other downstream 55013 14001934 ~ 14009536 (-) False tmprss13b
XR_006251004.1 other downstream 55013 14003214 ~ 14009536 (-) False tmprss13b
TU53547 other downstream 216490 13846378 ~ 13848059 (-) False LOC122345901
TU53907 other upstream 205587 14292063 ~ 14302381 (-) True LOC122345141
XR_006251010.1 other upstream 1119475 15205951 ~ 15264945 (-) False pdzd2
XR_006250970.1 other upstream 1209542 15296018 ~ 15308440 (-) False zfr
XR_006251075.1 other upstream 1263540 15350016 ~ 15367413 (-) False npr3
TU54482 other upstream 1486635 15573111 ~ 15574817 (-) False alkbh2

Expression Profile