RNA id: XM_022670136.1



Basic Information


Item Value
RNA id XM_022670136.1
length 13301
RNA type mRNA
GC content 0.47
exon number 63
gene id muc2
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_035901.1
NCBI id CM008304.1
chromosome length 40584741
location 1761227 ~ 1794932 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome
species mexican tetra
(Astyanax mexicanus)

Sequence


ATGGGGAATTACCGAGCGGTTCCGACGTGGGCGCTGAGATGGATGGTACTAGCCGTTGGAATAAGCTCCACACAGACAGCGGACGGACCGGTCAACATCATTCCTCAGATGACCAAGATAACCATGACCTCAGGTGTGAGCCCTGCTCATAACGAACGAGTCTGCAGCACATGGGGGAACTACCACTTCAAGACCTTCGATGGAGATATCTTCCAGCTGCCGTCCACCTGCAACTACATCCTGACCTCTCAATGCAAGGGGAGCTACGAGGACTTCAACATCCAGATGCGGCGGCAGGTGGAGGACGGCCATCCTACCATCACCAAGATCACCATGAAGCTGGAGGGCACGGCGGTGGAGCTGACCAACAACTCCGTCACTGTGGACGACCAGGAGGTGACTTTGCCCTACAGCCACTCTGGAGTCCTGATCGAGAAAAACCCCTCTTACATCAAGGTTTCAGCCAAGCTGGGACTCGTGGCCTGGTGGAATGGGGAAGATGCTCTCATGATTGAACTCGACAACAAGTACAAAAATCAGACttgtggactctgtggtgacTTTAATGGAGTCCAGCTCTACAATGAGTTCATCATGAACGgtgCTGAGATATCTCCATCAGACTTTGGACAATTTGCCAAGATAGATGCTCCAACAGAGAGCTGCACTGCTTTACCCACACCATCAGATGACAAGTGCACCAAACTGACGGCAGTGTGTGAGCAGCTGTTCTCAGGTCCAGCCTTCAACAGCTGCAAGGAACTGGTGCCTCTCGACTTCTTCATCAAAGCCTGCGAGGAGGACATGTGCCAGTGCAGCAGCAACTCCAGCTCATTCTGCCTGTGCAGCACCCTCTCAGAGTTCTCCCGCCAGTGCGTTCACGCCGGCGGGAAACCCGGCCAGTGGAGGACTGATCAGTTCTGCTgtgCTGAGATATCTCCATCAGACTTTGGACAATTTGCCAAGATAGATGCTCCAACAGAGAGCTGCACTGCTTTACCCACACCATCAGACGACAAGTGCACCAAACTGACGGCAGTGTGTGAGCAGCTGTTCTCAGGTCCAGCCTTCAACAGCTGCAAGGAACTGGTGCCTCTCGACTTCTTCATCAAAGCCTGCGAGGAGGACATGTGCCAGTGCAGCAGCAACTCCAGCTCCTTCTGCCTGTGCAGCACCCTCTCAGAGTTCTCCCGCCAGTGCGTTCACGCCGGCGGGAAACCCGGCCAGTGGAGGACTGATCAGTTCTGCTCCAAGACATGCCCTAACAAGAACATGGTGCACCAGGAGTGTGGGAACCCATGTATCAACACCTGCTCCAACCCTGACCGAGGccatgtctgtgaaagccactGCATCGACGGCTGCTTTTGTCCAGCAGGTTATGTGCTTGATGACCTCACCGGTAAAGGCTGCATTGCTCAGGAACAGTGTTCCTGCACCCACAATGGAAAGGTCTATCAGCCTGGACAATCCTTCACCAGCAACTGCAAAGAATGCACATGCACCTCTAATCAATGGAGCTGTAAAGAGAAAGACTGTCCTGGGACCTGCTCTGTGGAGGGAGGGTCTCATATCAGCACATTCGATGGAAAGGCATACAATTTCCATGGTGACTGTACATACGTCCTTACTAAGCATACCAATGGCACAGAGTTCACGGTTGTAGGAGATCTGGTGAGGTGTGGTCTGACTGATACAGAGACGTGTCTGAAGGCAGTCACCCTGGCCCTTTCTGGAGGAAACACTGTGTTCAGCATCCAGCCAGATGGAAAGGTCTTCGTCAACAGGCTCTTCTCCCAGCTGCCTCTCTCTACAGCGGGCGTGAACATTTTCAGACCAACCACCTTTTATATCATCGTCCAGACTTCATTTGGTCTTCAGATGGAGATCCAGCTTGTGCCAATCATGCAGGTCTACATAACTGTGGATGTGACTCTTAAGGGGAAGTTAAATGGCCTGTGTGGAAATTTTAATGACATGCAGAGTGATGATTTCACCACTGCGAGTGGAGTCTGTGAGGGAACCGGAGTAGGATTTGCCAACAGCTGGAGGACCAGAGCTAACTGCCCTGAGGTGAAGAACAGCTTTGAGAACCCATGCAGTCTTAGTCTGGAAAACGAGAAATACGCTCAGCACTGGTGCTCTCTGCTGACCGACTCTAAGGGGGTTTTTGCTCCATGCCACAACGAGATCAGCCCTGATATCTACCAAAAGaacTGCATATACGACACCTGTAACTGTGAGAACAGCGAGAGCTGCATGTGTGCAGCGCTGTCGTCGTATGTTCATGCTTGTGCTGCTAAAGGGATCTATCTCACCGGCTGGAGGAGCGAAGTCTGCACGAAGTATACCACCTGCCCCAGCACCATGGTCTACTCCTATGACGTTCAGAACAGTACCCAGTCCTGCCGCTGCCACAGTGACCCAGACTTCACCTGCGCTGCCACCTTCGAGCCGGTAGACGGCTGCGTCTGCGCCTCTGGAATGTATCTTGATGAAGGTGGAAAGTGTGTCTCACCCAGTAAATGTTCCTGCTACTATAAAGGATCAATGATTCCCCCTGGAGAGGTCATCAGTAAAGATGGCGCCATGTGCACCTGTAAGAATGGCCAGCTCAGTTGCATTGGACATTCCACAGACCAACCAACTTGCTCCTCACCGATGGTGTTCTTCAACTGCTCCAGCACGGCACCTGGATCCACAGGCTCCGAGTGCCAGAAGAGCTGCAACAACCTGGACATGTCCTGTATCAGTACTGAGTGTATCTCGGGCTGTGTTTGCCCCGCTGGCCTCGTCTATGATGGGAACGGAGGGTGCATTAAGGAGGAACTGTGCCCCTGCGTCCACAACAGTGTTCTTCACCAACCTGGAGAGTCCATCAAAGTCGACTGCAATACCTGCACATGCAAAGACAGGAAATGGCAGTGCACTGAAAACCCGTGCTATGGAACCTGCACAGCTTATGGTGACGGACATTACATCACATTCGATGGGAAAAGATATACCTTTGATGGAGACTGTGAATACACCCTTGTCAGAGATCATTGTGGTCACACTAATGCCAGCGCTACCTTCAGAGTCATCACTGAAAACATTCCCTGTGGAACCACCGGCACAACCTGCTCCAAGGCTATCAAGCTCTTCCTTGGGagGAACGAGCTCATACTGACAGATGGAAGCTATCAAGTTGTCCAAAGAGATCAGGGTGATGAAATTCCTTACCAGATCCGAGTAATGGGAATCTATCTGGTGATAGAGACCAATAATGGCGTGATTCTTATGTGGGACCGGAAAACAAGCATATTTATCAAGCTGAATCCAGAATACAAGGGTGCTGTCTGCGGTCTTTGTGGAAATTATGACGGCAATTCAAAGAATGACTTCACCTTGAGGAACCAAGGAGTGGTGAACAATGCGCTGGACTTTGGAAACAGCTGGAAGGATTCATCCAGCTGCCCGAGTGCAAAGAGCATCCAAAACCCCTGCTCCTTTAACCCCTACAGGCAGGCCTGGGCTGAAAAACAGTGCAGCATCATCAAGAGTGATGTTTTTAAAGCCTGTCACTCACAAgTGGATCCTACTCCGTATTATGATGCTTGTGTGTGGGATTCGTGTGCTTGTGATACTGGAGGAGACTGTGAGTGTTTCTGCACTGCTGTCGCAGCCTACGCTGAAGCCTGTAATGAGGGTGGAGACTGTGTTGCTTGGAGAACTCCTAATTCCTGCCCACTCTTCTGTGATTACTACAACCCTCCTGGTGAGTGTGAGTGGCACTACAAACCATGTGGCGCCCCCTGTATGAAGACCTGCAGGAATCCCTCTGGCACATGTTCCAGTCAGATACCTCCACTGGAAGGCTGTTATCCAAAATGTCCTGCTGACCAGCCATACTTTGATGAGGACCAAATGAAGTGTGTTGACAACTGTGGCTGCTATGACAAGGAAGGAAACCATTACACTGATGGAGAGAATGTTCCCACCACAGAAAACTGTCAGACATGCTCTTGCCATTCTATGACAATTGACtgcaaaaaagagcaaaaagCCTGTACCTGCCCTTACCTTGGGAAGAAATATCCCTTTGGAAGCATTATCTACAATACCACTGATGGGAATGGCCACTGTATGCTAGCTACATGTGGAGATGATGGCAAAATCGAAAGGAACATGTTTCCTTGTTCAACACCAGCCCCAACCACATCACAATCCACTCCAACAACAACTCCAACTACGACTTCCacaacaactccaacaacaACTCCAACTACGACTTCCacaacaactccaacaacaACTCCAACTACGACTTCCacaacaactccaacaacaactaccaccactccaacaacaactccaacaacaACTACCACCACTCCAACAACAACTCCAACTACGACTTCCacaacaactccaacaacaactcaaaacaactcaacaacaactccaacaacaactccaacaacaactccaacaacaactccaacaacaactccaacaacaactacaacaactccaacaacaactaccaccactccaacaacaactccaacaacaactccaacaacaACTACCACCACTCCAACAACAACTCCAACTACGACTTCCacaacaactccaacaacaactccaacaaccactccaacaacaactccaacaacaactccaacaacaactccaacaacaactccaacaacaACTACCACCACTCCAACAACAACTACCACCCCCCCAACAACAACTCCAACCACAACCTTACCTCCAACTTGCGAACCTTGCCACTGGTCAGATTGGATGGACTTTGGTCCTCCTACAACAGGTGGCAATGGTGGTGAAATTGTGCCAATAAAAAGAATAACTGACACTTATCCCAGTGTCTGTGGCAAACCCAGTGAAGTGCAATGCAGAGCAAAACTCTACCCTGGACTTCCACTTGCAGATTTGGGCCAAGAAATCAGAACATTGTacaacaactccaacaacaactcaacaacaactccaac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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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XR_002649919.1 lncRNA downstream 8735 1803667 ~ 1806941 (+) True LOC111192496
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XM_015608586.2 mRNA upstream 334110 1420391 ~ 1427117 (+) True polr2l
XM_007260233.3 mRNA upstream 454986 1292789 ~ 1306241 (+) True LOC103026058
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XM_022670138.1 mRNA downstream 14670 1809602 ~ 1836384 (+) True LOC103030943
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Expression Profile