RNA id: TCONS_00011975



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00011975
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_006063
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 30251741 ~ 30251857 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTATACGGCCTTATCAACCTGCACCTCAAGatcagttactcactgaagctaagcaggactgagcctggtcagtacctggattggagaccaattgtgaaaactaggttgctgtcggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175015

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00011972 lncRNA upstream 18061 30228101 ~ 30233680 (+) False XLOC_006062
TCONS_00011974 lncRNA upstream 21391 30228121 ~ 30230350 (+) True XLOC_006062
TCONS_00013407 lncRNA upstream 359921 29889189 ~ 29891820 (+) True XLOC_006056
TCONS_00013625 lncRNA upstream 802020 29446817 ~ 29449721 (+) True XLOC_006049
TCONS_00013623 lncRNA upstream 1154215 28915548 ~ 29097526 (+) False XLOC_006042
TCONS_00013626 lncRNA downstream 424968 30676825 ~ 30677643 (+) True XLOC_006067
TCONS_00013627 lncRNA downstream 668697 30920554 ~ 30928661 (+) True XLOC_006074
TCONS_00011994 lncRNA downstream 699410 30951267 ~ 30955038 (+) True XLOC_006075
TCONS_00012021 lncRNA downstream 1279574 31531431 ~ 31532435 (+) True XLOC_006094
TCONS_00013628 lncRNA downstream 1554663 31806520 ~ 31837960 (+) False XLOC_006101
TCONS_00011971 mRNA upstream 16521 30228083 ~ 30235220 (+) False XLOC_006062
TCONS_00011973 mRNA upstream 17344 30228118 ~ 30234397 (+) False XLOC_006062
TCONS_00011969 mRNA upstream 17346 30225262 ~ 30234395 (+) False XLOC_006062
TCONS_00011970 mRNA upstream 17348 30228077 ~ 30234393 (+) False XLOC_006062
TCONS_00011968 mRNA upstream 26430 30215910 ~ 30225311 (+) False XLOC_006062
TCONS_00011976 mRNA downstream 169615 30421472 ~ 30552592 (+) False XLOC_006064
TCONS_00011977 mRNA downstream 254924 30506781 ~ 30570859 (+) True XLOC_006064
TCONS_00011979 mRNA downstream 320315 30572172 ~ 30575799 (+) False XLOC_006066
TCONS_00011980 mRNA downstream 320403 30572260 ~ 30575717 (+) True XLOC_006066
TCONS_00011981 mRNA downstream 440812 30692669 ~ 30695994 (+) True XLOC_006068
TCONS_00011948 other upstream 465720 29778337 ~ 29786021 (+) False XLOC_006055
TCONS_00011936 other upstream 496314 29755293 ~ 29755427 (+) True XLOC_006054
TCONS_00011935 other upstream 660626 29590994 ~ 29591115 (+) True XLOC_006053
TCONS_00011924 other upstream 1326776 28924846 ~ 28924965 (+) True XLOC_006043
TCONS_00011911 other upstream 1511372 28740235 ~ 28740369 (+) True XLOC_006037
TCONS_00011978 other downstream 259750 30511607 ~ 30511723 (+) True XLOC_006065
TCONS_00011984 other downstream 584799 30836656 ~ 30836776 (+) True XLOC_006071
TCONS_00012034 other downstream 1517964 31769821 ~ 31777526 (+) True XLOC_006100
TCONS_00012037 other downstream 2140526 32392383 ~ 32392499 (+) True XLOC_006105
TCONS_00012044 other downstream 2594636 32846493 ~ 32846609 (+) True XLOC_006111