RNA id: TCONS_00012045



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00012045
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_006113
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 32984654 ~ 32984769 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


actagcagctagctctctgcaactctcacatggtctaCCAATTAAAGCTAAGCAGgcctgcgcccggtcagtacctggatggaagaccacatgggaaagctaggttgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178705

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00013634 lncRNA upstream 67728 32906643 ~ 32916926 (+) True XLOC_006112
TCONS_00013408 lncRNA upstream 876182 32105265 ~ 32108472 (+) True XLOC_006103
TCONS_00013633 lncRNA upstream 1006170 31955220 ~ 31978484 (+) True XLOC_006102
TCONS_00013631 lncRNA upstream 1134146 31806781 ~ 31850508 (+) False XLOC_006101
TCONS_00013409 lncRNA downstream 120142 33104911 ~ 33105228 (+) True XLOC_006116
TCONS_00012056 lncRNA downstream 261443 33246212 ~ 33247575 (+) True XLOC_006118
TCONS_00013635 lncRNA downstream 730507 33715276 ~ 33968528 (+) True XLOC_006132
TCONS_00012079 lncRNA downstream 1710957 34695726 ~ 34698270 (+) True XLOC_006134
TCONS_00013636 lncRNA downstream 1767405 34752174 ~ 34753090 (+) False XLOC_006135
TCONS_00012043 mRNA upstream 171751 32807419 ~ 32812903 (+) True XLOC_006110
TCONS_00012042 mRNA upstream 188625 32740509 ~ 32796029 (+) True XLOC_006109
TCONS_00012041 mRNA upstream 188637 32740509 ~ 32796017 (+) False XLOC_006109
TCONS_00012040 mRNA upstream 343117 32636197 ~ 32641537 (+) True XLOC_006108
TCONS_00012039 mRNA upstream 527812 32454262 ~ 32456842 (+) True XLOC_006107
TCONS_00012046 mRNA downstream 39778 33024547 ~ 33034374 (+) True XLOC_006114
TCONS_00012047 mRNA downstream 70779 33055548 ~ 33065830 (+) True XLOC_006115
TCONS_00012048 mRNA downstream 132759 33117528 ~ 33123240 (+) True XLOC_006117
TCONS_00012049 mRNA downstream 261381 33246150 ~ 33251640 (+) False XLOC_006118
TCONS_00012050 mRNA downstream 261401 33246170 ~ 33248715 (+) False XLOC_006118
TCONS_00012044 other upstream 138045 32846493 ~ 32846609 (+) True XLOC_006111
TCONS_00012037 other upstream 592155 32392383 ~ 32392499 (+) True XLOC_006105
TCONS_00012034 other upstream 1207128 31769821 ~ 31777526 (+) True XLOC_006100
TCONS_00011984 other upstream 2147878 30836656 ~ 30836776 (+) True XLOC_006071
TCONS_00011978 other upstream 2472931 30511607 ~ 30511723 (+) True XLOC_006065
TCONS_00012076 other downstream 1441479 34426248 ~ 34426365 (+) True XLOC_006133
TCONS_00012081 other downstream 1898477 34883246 ~ 34883370 (+) True XLOC_006136
TCONS_00012082 other downstream 1984750 34969519 ~ 34969645 (+) True XLOC_006137
TCONS_00012108 other downstream 3607425 36592194 ~ 36606932 (+) False XLOC_006151
TCONS_00012134 other downstream 4689409 37674178 ~ 37674294 (+) True XLOC_006162