RNA id: TCONS_00012159


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00012159
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_006177
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 39969349 ~ 39969465 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCCACAGTCCAATCACCCTGCAGCCTAAGGCCGGTTAcgtactgaagctaagcagggctgagcctagtcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggatGCAGTTGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176936

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00013660 lncRNA upstream 95721 39845264 ~ 39873628 (+) False XLOC_006176
TCONS_00013661 lncRNA upstream 122635 39845265 ~ 39846714 (+) True XLOC_006176
TCONS_00012158 lncRNA upstream 241885 39684471 ~ 39727464 (+) False XLOC_006175
TCONS_00013659 lncRNA upstream 241885 39711275 ~ 39727464 (+) True XLOC_006175
TCONS_00013658 lncRNA upstream 1685150 38226076 ~ 38284199 (+) False XLOC_006165
TCONS_00013411 lncRNA downstream 358095 40327560 ~ 40330374 (+) False XLOC_006179
TCONS_00013662 lncRNA downstream 380403 40349868 ~ 40352308 (+) True XLOC_006180
TCONS_00013663 lncRNA downstream 390695 40360160 ~ 40419304 (+) False XLOC_006181
TCONS_00012164 lncRNA downstream 390708 40360173 ~ 40372741 (+) False XLOC_006181
TCONS_00013412 lncRNA downstream 390839 40360304 ~ 40372744 (+) False XLOC_006181
TCONS_00012157 mRNA upstream 435984 39532050 ~ 39533365 (+) True XLOC_006174
TCONS_00012156 mRNA upstream 632166 39324865 ~ 39337183 (+) True XLOC_006173
TCONS_00012155 mRNA upstream 646223 39315881 ~ 39323126 (+) True XLOC_006172
TCONS_00012152 mRNA upstream 646477 39277178 ~ 39322872 (+) False XLOC_006172
TCONS_00012154 mRNA upstream 656834 39297802 ~ 39312515 (+) False XLOC_006172
TCONS_00012160 mRNA downstream 49536 40019001 ~ 40061830 (+) False XLOC_006178
TCONS_00012161 mRNA downstream 64711 40034176 ~ 40056501 (+) True XLOC_006178
TCONS_00012163 mRNA downstream 365262 40334727 ~ 40354313 (+) False XLOC_006180
TCONS_00012165 mRNA downstream 468085 40437550 ~ 40445352 (+) False XLOC_006182
TCONS_00012166 mRNA downstream 468085 40437550 ~ 40456995 (+) False XLOC_006182
TCONS_00012137 other upstream 1691368 38226157 ~ 38277981 (+) False XLOC_006165
TCONS_00012135 other upstream 1818712 38150517 ~ 38150637 (+) True XLOC_006163
TCONS_00012134 other upstream 2295055 37674178 ~ 37674294 (+) True XLOC_006162
TCONS_00012108 other upstream 3362417 36592194 ~ 36606932 (+) False XLOC_006151
TCONS_00012082 other upstream 4999704 34969519 ~ 34969645 (+) True XLOC_006137
TCONS_00012162 other downstream 358097 40327562 ~ 40328237 (+) True XLOC_006179
TCONS_00012184 other downstream 2041820 42011285 ~ 42018948 (+) False XLOC_006196
TCONS_00012186 other downstream 2072761 42042226 ~ 42042342 (+) True XLOC_006197
TCONS_00012203 other downstream 3670494 43639959 ~ 43656324 (+) False XLOC_006211
TCONS_00012209 other downstream 4131380 44100845 ~ 44100965 (+) True XLOC_006215