RNA id: TCONS_00012560


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00012560
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_006476
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 10912486 ~ 10912602 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCCAGCCCCAGCCATACCACCTTGCAACCCGAGACCGGTTACTCActtaagctaagcagggctaagcctggtcagtacctggatgggacacatgggaaaactaaattgttgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178090

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00013761 lncRNA downstream 565596 10331102 ~ 10346890 (-) False XLOC_006472
TCONS_00013760 lncRNA downstream 565599 10275286 ~ 10346887 (-) False XLOC_006472
TCONS_00012552 lncRNA downstream 565606 10333719 ~ 10346880 (-) True XLOC_006472
TCONS_00012551 lncRNA downstream 566237 10287702 ~ 10346249 (-) False XLOC_006472
TCONS_00013464 lncRNA downstream 659452 10250174 ~ 10253034 (-) True XLOC_006469
TCONS_00013465 lncRNA upstream 440538 11353140 ~ 11378392 (-) False XLOC_006479
TCONS_00012570 lncRNA upstream 464844 11377446 ~ 11378355 (-) False XLOC_006479
TCONS_00013762 lncRNA upstream 530236 11442838 ~ 11445390 (-) False XLOC_006480
TCONS_00013763 lncRNA upstream 530236 11442838 ~ 11445780 (-) True XLOC_006480
TCONS_00013466 lncRNA upstream 1204511 12117113 ~ 12118250 (-) True XLOC_006497
TCONS_00012557 mRNA downstream 181161 10682427 ~ 10731325 (-) False XLOC_006475
TCONS_00012559 mRNA downstream 182430 10696392 ~ 10730056 (-) True XLOC_006475
TCONS_00012558 mRNA downstream 184936 10683864 ~ 10727550 (-) False XLOC_006475
TCONS_00012556 mRNA downstream 239948 10649069 ~ 10672538 (-) True XLOC_006474
TCONS_00012553 mRNA downstream 291692 10360444 ~ 10620794 (-) False XLOC_006473
TCONS_00012561 mRNA upstream 13926 10926528 ~ 10945394 (-) False XLOC_006477
TCONS_00012562 mRNA upstream 14226 10926828 ~ 10945366 (-) False XLOC_006477
TCONS_00012563 mRNA upstream 23828 10936430 ~ 10945288 (-) True XLOC_006477
TCONS_00012564 mRNA upstream 68153 10980755 ~ 11035420 (-) False XLOC_006478
TCONS_00012565 mRNA upstream 69177 10981779 ~ 11072964 (-) False XLOC_006478
TCONS_00012550 other downstream 647581 10264741 ~ 10264905 (-) True XLOC_006471
TCONS_00012548 other downstream 793551 10097851 ~ 10118935 (-) False XLOC_006467
TCONS_00012547 other downstream 797606 10080027 ~ 10114880 (-) False XLOC_006467
TCONS_00012530 other downstream 1470154 9440328 ~ 9442332 (-) True XLOC_006454
TCONS_00012528 other downstream 1543951 9362226 ~ 9368535 (-) True XLOC_006453
TCONS_00012566 other upstream 107672 11020274 ~ 11022106 (-) False XLOC_006478
TCONS_00012571 other upstream 465414 11378016 ~ 11378294 (-) True XLOC_006479
TCONS_00012573 other upstream 653134 11565736 ~ 11565863 (-) True XLOC_006482
TCONS_00012589 other upstream 1061850 11974452 ~ 11974568 (-) True XLOC_006492
TCONS_00012595 other upstream 1193176 12105778 ~ 12105894 (-) True XLOC_006496