RNA id: TU7148



Basic Information


Item Value
RNA id TU7148
length 15230
lncRNA type intronic
GC content 0.41
exon number 4
gene id G6460
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000000
NCBI id null
chromosome length 19091038
location 9570858 ~ 9586592 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence


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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TU7204 lncRNA downstream 116564 9454084 ~ 9454294 (-) True G6516
TU7203 lncRNA downstream 117510 9453062 ~ 9453348 (-) True G6515
TU7201 lncRNA downstream 119688 9450908 ~ 9451170 (-) True CI01000000_09451613_09452011
TU6906 lncRNA downstream 203285 9367348 ~ 9367573 (-) True G6229
TU7209 lncRNA upstream 64932 9651524 ~ 9651735 (-) True G6521
TU7215 lncRNA upstream 73633 9660225 ~ 9660450 (-) True G6527
TU7216 lncRNA upstream 74164 9660756 ~ 9660960 (-) True G6528
TU7220 lncRNA upstream 86348 9672940 ~ 9673552 (-) True G6532
TU7223 lncRNA upstream 92314 9678906 ~ 9679119 (-) True G6535
CI01000000_09506970_09508416.mRNA mRNA downstream 61532 9506292 ~ 9509326 (-) True CI01000000_09506970_09508416
CI01000000_09469075_09494668.mRNA mRNA downstream 74878 9469020 ~ 9495980 (-) True CI01000000_09469075_09494668
CI01000000_09451613_09452011.mRNA mRNA downstream 118672 9450612 ~ 9452186 (-) False CI01000000_09451613_09452011
CI01000000_09421380_09425048.mRNA mRNA downstream 145810 9421277 ~ 9425048 (-) True CI01000000_09421380_09425048
CI01000000_09059743_09060201.mRNA mRNA downstream 510657 9059642 ~ 9060201 (-) True CI01000000_09059743_09060201
CI01000000_09913788_09975299.mRNA mRNA upstream 327067 9913659 ~ 9976167 (-) True CI01000000_09913788_09975299
CI01000000_10096840_10101549.mRNA mRNA upstream 510132 10096724 ~ 10101758 (-) True CI01000000_10096840_10101549
CI01000000_10106854_10121986.mRNA mRNA upstream 520065 10106657 ~ 10123017 (-) True CI01000000_10106854_10121986
CI01000000_10151976_10164598.mRNA mRNA upstream 565343 10151935 ~ 10164862 (-) True CI01000000_10151976_10164598
CI01000000_10168220_10187727.mRNA mRNA upstream 581531 10168123 ~ 10187937 (-) True CI01000000_10168220_10187727
TU4363 other downstream 3167333 6157013 ~ 6403525 (-) False G3931
TU4125 other downstream 3570089 6000407 ~ 6000769 (-) True G3716
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TU3917 other downstream 4104342 5465454 ~ 5465799 (-) True G3519
TU3038 other downstream 5180706 4386383 ~ 4390152 (-) True G2730
TU8769 other upstream 817736 10404328 ~ 10414513 (-) True G7948
TU8770 other upstream 1237819 10827450 ~ 10827595 (-) True G7949
TU8948 other upstream 1453677 11040269 ~ 11040909 (-) True G8125
TU9592 other upstream 3698732 13285324 ~ 13311429 (-) False G8699
TU9587 other upstream 3717684 13304276 ~ 13311429 (-) True G8699

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