RNA id: TU9080



Basic Information


Item Value
RNA id TU9080
length 18779
lncRNA type antisense_over
GC content 0.39
exon number 2
gene id G8243
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000000
NCBI id null
chromosome length 19091038
location 11765956 ~ 11784772 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence


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Function


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KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU9092 lncRNA downstream 144537 11621182 ~ 11621419 (-) True G8255
TU9091 lncRNA downstream 145139 11620559 ~ 11620817 (-) True G8254
TU9090 lncRNA downstream 145589 11620101 ~ 11620367 (-) True G8253
TU9083 lncRNA downstream 146211 11618854 ~ 11619745 (-) True G8246
TU9088 lncRNA downstream 150991 11614726 ~ 11614965 (-) True G8251
TU9050 lncRNA upstream 93748 11878520 ~ 11891383 (-) False G8218
TU9052 lncRNA upstream 106406 11891178 ~ 11891383 (-) False G8218
TU9053 lncRNA upstream 106406 11891178 ~ 11891381 (-) True G8218
TU9048 lncRNA upstream 109145 11893917 ~ 11896970 (-) False CI01000000_11894953_11903178
TU9051 lncRNA upstream 109409 11894181 ~ 11896970 (-) False CI01000000_11894953_11903178
CI01000000_11721762_11759751.mRNA mRNA downstream 6205 11721567 ~ 11759751 (-) True CI01000000_11721762_11759751
CI01000000_11661528_11696310.mRNA mRNA downstream 69646 11661013 ~ 11696310 (-) True CI01000000_11661528_11696310
CI01000000_11650257_11652811.mRNA mRNA downstream 111230 11649904 ~ 11654726 (-) True CI01000000_11650257_11652811
CI01000000_11644676_11648034.mRNA mRNA downstream 117922 11644046 ~ 11648034 (-) True CI01000000_11644676_11648034
CI01000000_11603826_11605350.mRNA mRNA downstream 160606 11603800 ~ 11605350 (-) True CI01000000_11603826_11605350
CI01000000_11788953_11800880.mRNA mRNA upstream 4131 11788903 ~ 11801346 (-) True CI01000000_11788953_11800880
CI01000000_11815586_11816295.mRNA mRNA upstream 30195 11814967 ~ 11817364 (-) True CI01000000_11815586_11816295
CI01000000_11821402_11828549.mRNA mRNA upstream 36551 11821323 ~ 11828549 (-) True CI01000000_11821402_11828549
CI01000000_11847606_11852314.mRNA mRNA upstream 61866 11846638 ~ 11852727 (-) True CI01000000_11847606_11852314
CI01000000_11855933_11866514.mRNA mRNA upstream 70838 11855610 ~ 11866885 (-) True CI01000000_11855933_11866514
TU8948 other downstream 725047 11040269 ~ 11040909 (-) True G8125
TU8770 other downstream 938361 10827450 ~ 10827595 (-) True G7949
TU8769 other downstream 1351443 10404328 ~ 10414513 (-) True G7948
TU4363 other downstream 5362431 6157013 ~ 6403525 (-) False G3931
TU4125 other downstream 5765187 6000407 ~ 6000769 (-) True G3716
TU9592 other upstream 1500552 13285324 ~ 13311429 (-) False G8699
TU9587 other upstream 1519504 13304276 ~ 13311429 (-) True G8699
TU9950 other upstream 1942028 13726800 ~ 13727090 (-) True G9036
TU10603 other upstream 2556230 14341002 ~ 14346534 (-) True G9602
TU10602 other upstream 2600585 14483120 ~ 14498594 (-) True G9601

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