RNA id: TU88408


Basic Information

Item Value
RNA id TU88408
length 17783
lncRNA type inter_gene
GC content 0.38
exon number 2
gene id G77530
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000013
NCBI id null
chromosome length 12551977
location 616917 ~ 634839 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

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TU88611 lncRNA downstream 202490 837329 ~ 837561 (+) True G77724
CI01000013_00561825_00581324.mRNA mRNA upstream 35341 560850 ~ 581576 (+) False CI01000013_00561825_00581324
CI01000013_00526975_00537006.mRNA mRNA upstream 79843 526975 ~ 537074 (+) True CI01000013_00526975_00537006
CI01000013_00490680_00491519.mRNA mRNA upstream 125287 490616 ~ 491630 (+) True CI01000013_00490680_00491519
CI01000013_00473761_00488628.mRNA mRNA upstream 128085 473138 ~ 488832 (+) True CI01000013_00473761_00488628
CI01000013_00441663_00456168.mRNA mRNA upstream 160461 441663 ~ 456456 (+) True CI01000013_00441663_00456168
CI01000013_00657437_00692874.mRNA mRNA downstream 22598 657437 ~ 692874 (+) True CI01000013_00657437_00692874
CI01000013_00849127_00850710.mRNA mRNA downstream 213751 848590 ~ 850969 (+) True CI01000013_00849127_00850710
CI01000013_00862608_00869073.mRNA mRNA downstream 227579 862418 ~ 869073 (+) True CI01000013_00862608_00869073
CI01000013_00870861_00871425.mRNA mRNA downstream 236022 870861 ~ 871522 (+) True CI01000013_00870861_00871425
CI01000013_01007844_01029438.mRNA mRNA downstream 373005 1007844 ~ 1029459 (+) True CI01000013_01007844_01029438
TU88411 other downstream 73994 708833 ~ 709549 (+) True G77533
TU88574 other downstream 311682 946521 ~ 952969 (+) True G77695
TU90328 other downstream 1831926 2466765 ~ 2467171 (+) True G79309
TU91155 other downstream 2949169 3584008 ~ 3584784 (+) True G80062
TU91262 other downstream 3430094 4064933 ~ 4065829 (+) True CI01000013_04051081_04064651

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