RNA id: TU95122



Basic Information


Item Value
RNA id TU95122
length 9025
lncRNA type sense_over
GC content 0.38
exon number 4
gene id G83641
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000013
NCBI id null
chromosome length 12551977
location 8717223 ~ 8819314 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence


AAATTAACTTGGCGCCAATACAGTCCTCACTGAGCCATCGGATTTTATCAAAAATATCTTAATTTGTGTTCCGAAGATGAACGAAGGTCTTACGGGTGTGGAACGACACGAGGGTGAGTAATTAATTACAGAATTTTCATTTTTGGGTGAACTAACCCTTTAAGAAGCACTTCGTAAACCTTCATATATTGCTTTTCACTGGTATGTTGAGTATCAAATCCTTATCAGTTGGTTATATAACAAACTATACAAAGAGATATTTTGAGAGCGAGTAAAGTGAATTTTGAGGAAATGATGGGCACATTTCCATCAAAAAAGGAGTCTGGTGTACGTTTGTGCCTTGATGTGGTTCCAGCACTTCAACAGCAAGAAATTCTTGTGCTCTTTGCTCTTTAAACTTGGCCCCTCATGTCATTTTGATTTAAAATGTGGTAAACGTATCCACATGAAAGCACCGCTGGGTTGCAGTTAGTTGTCAGTGCACTGTTAGAAACTTTGCGATAAGTCACTCTTTCAAGCTGGCAGTCGCCTCAATGCCTGTTATTTTGGAAACGCTCGTTTTTGCAGTGCATTTGGTTCACATGGCGTTTACAAACCTAATGTGGTTGCCAGGGTGTTGCTAGGTGGTTGCTTTTTGAAAAGCCTTTAACCCTACTTTAAATATGAACAATAGTAATAGTGAAGCTTACATTTTTCTTACAGGGTTAGTTCACCCAAAAATGACATTTCTGTCATTAATTACTCACCCTCATGTCGTTCCACACCTGTAAGACCTTTGTTTATCTTCACAACACAAATTAAGATATTTTTGATGAAATCCAAGGTTTTTTTTTTATCCCCCATAGAAAGCAACGTAATTACCATCATTCAATGTCCAGAAAAGTAGTAAAGACATTGTTAAAATAGTCAACGTGACTACAGTGGTTCAACCTTAATGTTATGAAGCGATGAGAATACTTTTTGTGCGAAAAACAAAAAACAAGAATAACGACTTTATTCAACAATTTATTTTCTACCCTGTCAGTCTCGTACGCAGTTGATGCAGTGAAAGCAGTGCAGCGCAGCGCTTCCGTGTTTACGTCTGAACGCCGGCTTTTTGGATGAACTAACCCTTTAAGGGGCCGTTTACATGACAGTGCATGTTTTCAAATTGAAAATTGAAAATTTTTTGATGCGTTTTGGCTGTTCATTTACATGACAACAGCGTTTTTGGGGCCTGAAAATGCAAGCTTTTGAAAACGGGTTTTAAAGTGCAAGTTTTTAAAAACGATACCGTTATCGTCTCCATGTAAGTTAAAAAACCCCCCGCAAATTTGTGAAAACGGTGATGTGATGCGAATGCATATTACATGTTCAGTTTGTAGGTGCTGTTTCTTTACAAAGTGACATCGCCAACTACTGGCCTGTCATGCATAATACACCGTTTTTAGTCGTTTTTTCAGACCCGAGTGAACGAGGATTGTTTTGACAGTGTTGTCATCTGTATGTGAAAAAAGCAGGAAAAAATTTTTAGTACATTGTTGTCATGTAAACATACCCTAAATTTCCTGTCATACTATGCTTTTTATTTATTTTATTTTATTGTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTGGTGGGGAGAATGGTTTAATTAGTGTAATGGCATTTTTAACGAGAAATTTGACTAGATTGCATCTTTGTCTGTCTCTCCTCCTCATAAAATAATTATGAGCGTATGATGTCACTTCACCCATGTAGTGCTTCTTTAAAAGGCCCGTTCATGTGGCACCCTGGAAAGCCTTTTATCGCTGAGAGCCTTTGAATCGTTTCTGGTGGTGCTTTCTAGGTCACTGTGTTATTTGTTGTTCTTGCACTCCTGTGTTTATTTAAAAAAAAGAGGGTTAACCTAGAGGGGGGATGGGCAAAATGTTCCAGTAGGGTTTTTTCTTGTCTAGTTGGCCAAGCCCACTCAACCCCCCAAAAGCAGGCATCAATCTCAGCAGCTTGACCCAGAAACACACCTCTTTCTCGGTTGCTAAGCGATTTGAATCCATGATGAACAATTAGCCTGAATTAAAGATCATTTAGAAACATTTTGTTAACTAAGTACTAGCATTAGTGTGCTCTCAGGCTGGGCGATACAGCCTTTTAAGCGATAATAGACAGATGTGTACAGTATATATTTTCCAATGTTTTCAGTGTTTCATAAATGATATGTTTTTAATATTTCACTTAATAAAAAAGATAATATTTGATATATATTGCCCAGCTCTAGTAAGGGCTAATTCCTGATCTTCTTGATTGCAGAGCTTTAGCTTTTCTGCATCTTCTGTTGTTTTTTGTGAACCACTTGATTTATTTTCATCCCAGTCATTTTTATTAACTGGAGATTATACCTTTTGAATAACATGACCTTTTCTCCCATGTGGTCTTAGTACGTAAATATATTATCTTGCATTTTTACTTGACTTGCACAGAATGCATTTATCAACCTGTACAGATAACTTTTCACAGACCATGTTGCGGAATGATGTTCCCCCAATCACAATCCTTCTTGTACCAAGATGTTTATGAATTCCTGATCAGAGCATTGCTTCTGCAGGTTATCTGCATTCTTTACTAAATAAAATTCCTGCTGAAGTTATAAAGTGCTAGGAAGATTAAATGAGCCTTTCTTATCCAAGCGCTTTAAGCTCTCTAATAAGAAGAGGTAATGTTTCATGATGTTTCACTGTAACTTGGCTCAGCTCGAACGTTTCTTTGCCTGAGCTCTCAGATAAGATAATCTAATGTTTAGACAGCTTAAGCAATAGATTGTGCAGTGGTTAGATGTGGCTGTCAACACTAATTGTCTTCGTGCTGAACATTTGTATCCCTGGAGTGATAAATCTGGTTAAGTTCAGAATTCCCTTTCAGTTTCTTTACAGTTTCTTTTGTTTATGTAATTTTTTTTATTAGTGGTGTTTGTCAAGGCTAGTATTATTAGTGCTTATATTTATGATTATAGGCATTTAGAACAAACTCATCACCCTAAGTTTTACATTTTGGTTCATAATTTGTAAAGCACTAATTAAATGCCTCAGATTGTTCGCCTTGAGATGTACTTGTTTTGTAAGCAATTGGACTATCAATTTTCAATTTGCACCTGCTATGATAATACTAATACTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATGTATATAAATTGTTTGGCAACTACAATTATTAGAATGACTGGCACTGACATAATAACATAATATACCTTCTATATTTTAGCTTTCTATACTTTCTTGGTTTAAAAGTGAATAATATACAGTCCGTTGACAAATAAACACTACTGCTTCTATATTTTCACCACCATTTTATTGCAGAATGGGATGGGCTGCTTGTATTTCCCACATTCAGAACAAATGCCCTCAAGCTAGTCTCCATGCTAGTAAACACCCAAGACACATGGTCTTCTGTCAGCGGCGGTAACAGGCTGATGACATCTGTGTGCGTCTGTTTATGTTCGCAGTACTGCCTGTTGCACGTATAGTTGACTGCGAACAGTGTTCAAGAGGAAGTGCAAGGCTGTTATCTCAGAGCTAGTTTAGTCACCATCCTTCACACCTTCCTTCCTGCATGACACTTCATCCTCTGCCGCTGACATGCACACGCACTAACACTTTGACCCTAATTCTTTAAGAGGAGCTTTCCTGGGTTGTGCCTTGTGACCTTGTTCTGCGCATAGCCAGGATGGGAAAAGCAGCGACAGACTGACGTACACTGCAGCTGTTAAGAACGTGTTTGAAGATGTTTGGTCTGTTTTATTTTGCTTTAATAATATGTGTCTGTGAAGTTTCAGCTCACCCTTACAGATCATTTATTATAGCTTGTAATATTTGGGTGTGAGCGAAAACACGCCGTTTTTGTGCGTGTCCCTTTAATGGCAAATGAGCTGCTGCTCCCGGCCCGCTTTCCAGAAGAGGGCAGAGCTTTAACAGCTCGCGCTTCGGTTGCTCAACAACAACAAAGTTGGAGAATCTCACACAGCCAAAATGACGATTGTCAGTAACGGTGTTCAGCCTTCATTGTTCAAACCGGAGTCGGACACTGATGGAGAGACTAGTGGATAAATTTATGTAGTTGCTGTGGAGTTGATTCAACTCATCGACTAGCATGTGCCGTCATGTTAATCTTTTGTGCAAATTCAGCTTTGAATTGACCCTCGTTTGTGAAGCAGTCTGGCGTAAAATCACAGCATGGCAACAACACTCTACTACAACAACTTTTCATCTTCTCTAAAGCAGCCCAACATGGCCTCGCTCCCTTTGTTACGTGTTCTCGGGGGCAGGGTTTATGTAAATTTTAGGGTTAGTGATGTCACTAACCCAGGAAGAAGCTCGTTGTAGTCCCTACCAGCCATTTGTTGTAGTCCTTAAACAGAGAATTCTTTAAAAGAAATATCAACCTTTGCAATGAACTTTGAGCGTCGTAATTTTGCAGATGTTGTTTATGCTCTAACAGCAACATTACACACTAACAAAAGTTAAAAAAAAAAAGTGAAATCATAACCTTTAACAAAATGTCAGCTGCATTCATCAGAAACTGATTCAAATGAGAACTGACTTGAGTTTGCACCTTTTAAACCTCTTCAAGCCCAAAATAATATTATTTAATGCAGGAAGCTTTGGCAGAAGTAACTGTTGAGCAGCCACAAAGTCAGAGACCTCAAACGGTGTAACACTAGAAGCTTAACGTGTTTGAGAAGTGCCTTCTGACAGGCATTTCATAAAATTTAGATTGTTTTGATTTCTCTTACATAAAAAAAAGAGAACATTATATTTGCCATTACTTTCATCAGAAAGGAACACATTTCAGATTTTCAGTACTTGTACTGGCTAGTCAAACGGATCTACTTAGTTGCTCTTCTATATGGTGTCCTGGTGTATTTATGAATCTTTTGTTTTGTATGGTAATCTGTGATTGTTTGAGTTTTGTTTGGAGGGTTTACCGGGGTTGTACAAAAGTCATAATTGAAGTCATAATTTGAATTTGAATTGAATTAGCCACACCCCACAAAAAATTTAATTGGAATCTGAAATTACTGAATAGCTGCTCAAACAAATTCAACACATGTAATACATTTTGGCGAATGTTATCTGTCTCTACCTTCTAACTATATTTCATGTGTCATTTACATAAGGTAAACGCTGACTAGTTTTCTGGTAGACATCAGTAAAATGATTAGTTTTGCAAGCCCTATGAAAGTCATTGCACTATTCCTGTTTTCTCTCTCCATTCTCCATGTACCACCTGGAACCGTTTTCCTCTCCCCTGAGGTATTTTGAAGTGCCTGCATATTGCGACGCATTCAATAGCCTCTTCAGTGACAATGAATGGGCTTAACTATTGTTTCTCAGGGCTTTTCTTAGTTATCGGGACTATTTACCCACCGAGGGAGCTTCCGTTGTCTCGTAGGCATGGGGAATAGTCAAGCTGTTACTGGTTGAGTAATGGACCACACATGATCGAAGCTCACACTGTTCCTCTATTGCCGTGCCTTCAAGTGTGGGCAGAGGAGCACCTCTCCTTCTCCGCCTCTCCCTCGTTCTCACTCTCTGCCGCCAGTTGAGAGCCTCAGTTGTTTCTTTGTGTCATCCATTCATAAGGTTGGTGTATTGGGCAGAGCTGAGCCTGGTTCTTTGTCCTTAACGTTGGGAGGACCCTCCCTCAACCCCCCTCCCCTAATCTTTCTGCTCTCCATCTACAATCCAACAATAGACCACTAGCAAGCATCTCAGACATGCCATGAATGTTAGTTCTCTTTTGTTGGTTTTCGTTTACCCTGATTGAGCAGTGAAAAGCAGGCATTTCAATTTCAGACATTGACACTCAGGTTTTGTCTCATATCCGAGAGTTGTCTGCAGTCTGAAATGAGCATTTTATCTTCCTCTTTGTAAAGCCTAGACATTTAGATGCTTCAAAACGTTTTACTCGCATAGTCTGGGTAAAACTATTCTTAGCATTCTTATATATTATGTACAGCCATTGGTGCTCAAGCATTTCTATTGCTCAAACATAATATAATTCCCAGAGAATGCATAAACTCATCAAATTTATACATTGATTTCAATGCAAGATGCTTTGGTTGAAAGCGTCTGCCAAATACATAACTGTAATTTAAAATTTATTTTTTTAGTTATACTTTTTTTTTTTTTTTTTTATCTGAATTTCTAAGTAGATTGTTGAAATGTTGAAATGGTTATAGTTATAATGTCCATTTTGCTTCTGTAGAAAAAAAATCTGTCTTACTGAAATCGGTAACATCTTTTTGAACTATTCATTGAAAGAATTGTCTAATAATATTACATTGTATCTTTTGAATTCATTAAAAAGTGCGACTCATAAGACATTTTGTATGTAAGTGTATGTAACTCCATAGAATCGTGCTTCTTGGCATTATTTTGCGGTACACAGTCTTTATTGTATCGCATTCGATACAGACAGCAAACTCACATCCAAAACTTGCTAAAATGTCATTTCTTTTGCTGTGGCGCTGAAGATTCAGCAGCAGGAGAGCATTTGTGGGACAGGGAGAACATTTTCTCAATTCCCAATATCAATTGACTACAGAAGTGCATAATGATGCATCAAGTGTAGGTCAGTCCCGGAGCTATATTTTCAGTGTTTATATGTAATGAAAGGAGCCCGACCTTCTTCAGATGGTTGCCATAATCACATCTGCTGTTCTGCAACATAATATACAGCACTTAGTTTCATATTTTTCCATGAATTGTGTTTCAATCATAATTCCTCATACATGTGAAGGTCATTTTCTGGTTAAAACAAAAAACCGTTTGATGTGTTGGCAAATTCCTTCTCTTGTCTTGCATCGTTGGGGTCTGTAGTAATGTCTTAAATGACTGTGGACCTAATTGCTTTTTCCGCATCTGTAAAGTTCACACAAGTTACATTTTGTGCAAACTTAATAATGAATGACTTGAATTTATGCATTGTCTAGTAAACATGCAGTTTTTATTAGTGCAAAAGTTTTATTACTTGTTCACTGGCCTGCATCGACGGAAATATTAACGGATGTATTGAAAGTTTTCTGGAGTTATGAAAGTAATCCATTTGCAGGTTGATTTCCCTCAAGTATAAACAGATGGCAGTGATGATTTTAAAACTTTGCTTTGGTTCCCTTCTGGCGCAATAATTGCCTTGAGTTTGGGGGCGTGACTAACTGTTTGCGTGAAAAATTGCAGAAAGAGGTAGTGTTCGGGGACACATATTTCATGTTTTTGCGATTCCATTTGGTGCTGCTAGTAGCACAGAATTGACACTGTCACTTTAATTTGGATTGATGAAAATCTGTGTGTGTAAACAGTCACTGATTAGGATGTTTATGAAAGACCTCTTTTATGAACTTTTTCAAAATAATCTCAAGCATAAGCAGCACAGAAAACCTCTTCTCATGCACAAGGCTGTTGCTAATCAGGAAATACATTTTGTTTGACTTCAAAGACGCACATTTGACAATGGGAAATGGCCTCCTCCTGACAAATGTTTGTGCCTCTTTGCAGAGGAAATGAAAACACCTCTGGAACGTACTTTCAGCTTTAGGTTCATGCTCATACGTCCTGTCATCTGGAGGAATGTAGTAAGTGATTTGTCAAGAAGGCCTCATCTAAAGTGCTGACTTCCCCAATACCTCAGTTTTATTTTAAACAAATGGTTTCTGTCATCATAATTTTAGCAAAGTCAATCATGCACATTTTAGCCATAACTGTGGCGTGTGTTTTAGCTCCTTGTGGGTCAGTAATGTATTGTGTATTAGGTCTTTTTCCACATTAACAACAGTATAATGCAATTATAATGACGAGTGCGTGGTGTGCCACTGGCCTCATTCAAGGTGAGGTATTTGCTATAGCCTGTCTGTTTGGATTTGATTCCAGAAGACGGTGGAGATTTGGCTCAGAATGGTATTGATTGATGGATTGTACTCCTAGTATTCCTCTGTTTCTCCATCTCAGGCAGTGAGGAGGAGGGAAGGGTACATGAAATTTTAGCTTTTTTCTGATGGGTTTTCCCTCGGCGTGGTCGGCTTCAGTTGTGCACTGAAGATCTCTGGGGTTCTGATTCATTGAAACCATATGATGAACCAAATATTTCTGAAAGCATCCCAAGCAGTGAAATCTGCTAGCTATTTTTAAAATGATTTAAAATTAATAAGTCTTGGGTGGTAATTGGTAACTCAAGCTTGAAGTTTAGTGATACTTGGACTTCTTGGAGAACTGATGTCTTTCCTTTGCAGTCCAACGATGATTGAAAAGTCAATTGCGAAATCAAAAGGCTGTAAAACAGAATTGCTTACCAGGATGGTGGTGTGGTTTCTGTGATTTTGTGACTATAAAGTCTAAAATGCGTAAATGAGCTCCTTTACAAAAATGCAAATTGACACCATGTGGAAGACAAAGCATTTAAAAACAGTTAAGTGGCTGGTTGGGTTCCTTTTAAGAATGTTTACGGGATCACCAGACGCTTTCGTCTCACGCAATAGCACCGCTAAATATATTTTGGTAACTTTCGAATTAATGTCACGCCTTAAGGGGAAAGATTTTGTTGTATTTCATTTTATTGCAAACGTTTCCACCCCTCATTTTCCTTCCAGCCACTAATTTAAGAAAATCCTTAGTTTGTTTAAAAAGTCAAAGGCCAGTCTGCATTGAATGAAGTGTTTTGGATTGTTTTCTGGATGCTTCATCAGGGCTTTTTGCTTTTCACTCTTGTGTGGGAAAATAATTTATTGGTGATATTTTTAACTTTTTGAATATTTCCAACTTCTGTAATGTAAAATGATAGTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTGAAAAAGAAAAAGTGTAGGATGGGGACTTGGATCAGTTCATTGGCTGTTGATTAGATGGAGCCAGATCTGAATACAAGGGTGCAGTCGATTAGAAAGTCTGGGACTAGGCTTAAATCTTTGTCTGTGAAACCG

Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU95211 lncRNA downstream 2759 8714181 ~ 8714464 (-) True G83725
TU95210 lncRNA downstream 3754 8713204 ~ 8713469 (-) True G83724
TU95193 lncRNA downstream 29152 8687827 ~ 8688071 (-) True G83707
TU95192 lncRNA downstream 32128 8684886 ~ 8685095 (-) True G83706
TU95188 lncRNA downstream 39118 8677891 ~ 8678105 (-) True G83702
TU95296 lncRNA upstream 71982 8891296 ~ 8891501 (-) True G83767
TU95297 lncRNA upstream 74675 8893989 ~ 8894294 (-) True G83768
TU95305 lncRNA upstream 85999 8905313 ~ 8905562 (-) True G83776
TU95291 lncRNA upstream 387648 9206962 ~ 9207761 (-) True G83762
TU95294 lncRNA upstream 389504 9208818 ~ 9209453 (-) True G83765
CI01000013_08616374_08648611.mRNA mRNA downstream 68612 8616204 ~ 8648611 (-) True CI01000013_08616374_08648611
CI01000013_08555865_08573521.mRNA mRNA downstream 143702 8555208 ~ 8573521 (-) False CI01000013_08555865_08573521
CI01000013_08418098_08441411.mRNA mRNA downstream 275472 8417837 ~ 8441751 (-) True CI01000013_08418098_08441411
CI01000013_08311120_08328130.mRNA mRNA downstream 388880 8310985 ~ 8328343 (-) True CI01000013_08311120_08328130
CI01000013_08308180_08308362.mRNA mRNA downstream 407310 8307851 ~ 8309913 (-) True CI01000013_08308180_08308362
CI01000013_08950324_08962808.mRNA mRNA upstream 130664 8949978 ~ 8962808 (-) True CI01000013_08950324_08962808
CI01000013_09007324_09008538.mRNA mRNA upstream 187943 9007257 ~ 9008749 (-) True CI01000013_09007324_09008538
CI01000013_09293519_09305846.mRNA mRNA upstream 473819 9293133 ~ 9305846 (-) True CI01000013_09293519_09305846
CI01000013_09309438_09335834.mRNA mRNA upstream 490058 9309372 ~ 9336077 (-) False CI01000013_09309438_09335834
CI01000013_09336832_09367107.mRNA mRNA upstream 517258 9336572 ~ 9367304 (-) True CI01000013_09336832_09367107
TU94655 other downstream 1334863 7380297 ~ 7382360 (-) True G83206
TU94120 other downstream 2832851 5884149 ~ 5884372 (-) True G82727
TU92796 other downstream 2973185 5739526 ~ 5744038 (-) True G81547
TU92232 other downstream 3966662 4748809 ~ 4750561 (-) True G81032
TU92144 other downstream 4158320 4556868 ~ 4558903 (-) False G80954
TU95233 other upstream 487722 9307036 ~ 9322844 (-) True CI01000013_09309438_09335834
TU96930 other upstream 1660547 10479861 ~ 10480700 (-) True G85170
TU96941 other upstream 1744145 10572377 ~ 10572440 (-) True G85180
TU96958 other upstream 1772890 10592204 ~ 10595337 (-) True G85188
TU97193 other upstream 2215718 11035032 ~ 11035466 (-) True G85401

Expression Profile