RNA id: TU128448



Basic Information


Item Value
RNA id TU128448
length 12127
RNA type TUCP
GC content 0.39
exon number 2
gene id G113050
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000020
NCBI id null
chromosome length 7209782
location 4426658 ~ 4439762 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence


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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Loading

Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TU128465 lncRNA upstream 17836 4403183 ~ 4408822 (+) True G113067
TU128463 lncRNA upstream 45345 4381021 ~ 4381313 (+) True G113065
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TU128305 lncRNA upstream 203134 4222665 ~ 4223524 (+) True G112935
TU128458 lncRNA downstream 145306 4585068 ~ 4591113 (+) True G113060
TU128467 lncRNA downstream 240527 4680289 ~ 4680672 (+) True G113069
TU128455 lncRNA downstream 254093 4693855 ~ 4701724 (+) True G113057
TU128486 lncRNA downstream 366071 4805833 ~ 4806053 (+) True G113088
TU128497 lncRNA downstream 462330 4902092 ~ 4902684 (+) True G113098
CI01000020_04279888_04282279.mRNA mRNA upstream 144111 4279771 ~ 4282547 (+) True CI01000020_04279888_04282279
CI01000020_04273916_04275725.mRNA mRNA upstream 150551 4273738 ~ 4276107 (+) True CI01000020_04273916_04275725
CI01000020_04266512_04267515.mRNA mRNA upstream 158878 4266396 ~ 4267780 (+) True CI01000020_04266512_04267515
CI01000020_04240295_04242117.mRNA mRNA upstream 184285 4240191 ~ 4242373 (+) True CI01000020_04240295_04242117
CI01000020_04226010_04238699.mRNA mRNA upstream 187735 4225042 ~ 4238923 (+) True CI01000020_04226010_04238699
CI01000020_04446676_04465745.mRNA mRNA downstream 4484 4444246 ~ 4466188 (+) True CI01000020_04446676_04465745
CI01000020_04496296_04500632.mRNA mRNA downstream 56359 4496121 ~ 4501039 (+) True CI01000020_04496296_04500632
CI01000020_04540238_04552388.mRNA mRNA downstream 99436 4539198 ~ 4552553 (+) True CI01000020_04540238_04552388
CI01000020_04593462_04636463.mRNA mRNA downstream 153700 4593462 ~ 4636472 (+) True CI01000020_04593462_04636463
CI01000020_04646413_04669776.mRNA mRNA downstream 206322 4646084 ~ 4670074 (+) True CI01000020_04646413_04669776
TU128103 other upstream 693072 3714381 ~ 3733586 (+) True G112753
TU128026 other upstream 1122928 3301171 ~ 3303730 (+) True G112679
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TU126324 other upstream 1976851 2445064 ~ 2449807 (+) True G111173
TU126322 other upstream 1981102 2445064 ~ 2445556 (+) False G111173
TU128442 other downstream 320250 4785073 ~ 4793261 (+) True G113044
TU128430 other downstream 367265 4807027 ~ 4808872 (+) False CI01000020_04807118_04808453
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TU128433 other downstream 367265 4807027 ~ 4808974 (+) False CI01000020_04807118_04808453

Expression Profile


TU128448 Expression in PRJCA010000

Bar chart with 27 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 4.
End of interactive chart.

TU128448 Expression in each Bioproject

Bar chart with 44 bars.
TU128448 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 150.
End of interactive chart.