RNA id: TU163010



Basic Information


Item Value
RNA id TU163010
length 11777
lncRNA type inter_gene
GC content 0.37
exon number 2
gene id G143479
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000027
NCBI id null
chromosome length 10680226
location 8578428 ~ 8590320 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence


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Function


GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU162994 lncRNA downstream 45250 8528645 ~ 8533178 (-) True G143463
TU163120 lncRNA downstream 70464 8507732 ~ 8507964 (-) True G143585
TU163105 lncRNA downstream 136063 8441509 ~ 8442365 (-) True G143570
TU163091 lncRNA downstream 186767 8391458 ~ 8391661 (-) True G143560
TU162990 lncRNA downstream 190319 8385961 ~ 8388109 (-) True G143459
TU163132 lncRNA upstream 64860 8655180 ~ 8655488 (-) True G143597
TU163133 lncRNA upstream 66989 8657309 ~ 8657680 (-) True G143598
TU163136 lncRNA upstream 69740 8660060 ~ 8660513 (-) True G143601
TU163137 lncRNA upstream 70638 8660958 ~ 8661221 (-) True G143602
TU163138 lncRNA upstream 71267 8661587 ~ 8661806 (-) True G143603
CI01000027_08568349_08570750.mRNA mRNA downstream 7678 8567985 ~ 8570750 (-) True CI01000027_08568349_08570750
CI01000027_08537911_08550747.mRNA mRNA downstream 26970 8536827 ~ 8551458 (-) True CI01000027_08537911_08550747
CI01000027_08514843_08515829.mRNA mRNA downstream 60087 8514488 ~ 8518341 (-) True CI01000027_08514843_08515829
CI01000027_08483034_08503082.mRNA mRNA downstream 75346 8482939 ~ 8503082 (-) True CI01000027_08483034_08503082
CI01000027_08443968_08446252.mRNA mRNA downstream 131992 8443177 ~ 8446436 (-) True CI01000027_08443968_08446252
CI01000027_08595524_08646502.mRNA mRNA upstream 4618 8594938 ~ 8646502 (-) True CI01000027_08595524_08646502
CI01000027_08671118_08685781.mRNA mRNA upstream 80775 8671095 ~ 8685781 (-) True CI01000027_08671118_08685781
CI01000027_08688706_08696073.mRNA mRNA upstream 98371 8688691 ~ 8697369 (-) True CI01000027_08688706_08696073
CI01000027_08701843_08702938.mRNA mRNA upstream 110462 8700782 ~ 8702938 (-) True CI01000027_08701843_08702938
CI01000027_08713799_08734144.mRNA mRNA upstream 123234 8713554 ~ 8734144 (-) True CI01000027_08713799_08734144
TU162851 other downstream 692379 7884535 ~ 7886049 (-) True G143325
TU162783 other downstream 904659 7669329 ~ 7673769 (-) True G143267
TU161694 other downstream 1138237 7439178 ~ 7440191 (-) True G142299
TU161593 other downstream 1420430 7153637 ~ 7157998 (-) True G142209
TU161596 other downstream 1420615 7153623 ~ 7157813 (-) False G142209
TU163997 other upstream 1948460 10538780 ~ 10542148 (-) True G144365

Expression Profile