RNA id: TCONS_00016674



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00016674
length 165
RNA type mRNA
GC content 0.52
exon number 2
gene id XLOC_008296
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 6109861 ~ 6118668 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


atgccccagtatagtgagaGGGACTCTAGTGggtATGCGTCTAAGAAAGACGTGCCAGAGGACTTTGACATCGACATGGACGCCCCTGAAACCGAGAAGGCAGCCGTCGCCATTCAATCGCAGTTCAGGAAGTTCCAGAAGAAGAAGAACGATGACAAGTCGTAG

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000188293

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018886 lncRNA upstream 264160 5841557 ~ 5853342 (+) True XLOC_008291
TCONS_00018885 lncRNA upstream 645994 5468360 ~ 5471508 (+) True XLOC_008289
TCONS_00018884 lncRNA upstream 646651 5468098 ~ 5470851 (+) False XLOC_008289
TCONS_00018883 lncRNA upstream 838599 5277903 ~ 5278903 (+) True XLOC_008279
TCONS_00018755 lncRNA upstream 860720 5256501 ~ 5256782 (+) True XLOC_008278
TCONS_00018887 lncRNA downstream 40341 6159009 ~ 6160503 (+) True XLOC_008297
TCONS_00018756 lncRNA downstream 666981 6785649 ~ 6786055 (+) True XLOC_008304
TCONS_00018888 lncRNA downstream 748608 6867276 ~ 6875548 (+) True XLOC_008306
TCONS_00018757 lncRNA downstream 1021742 7140410 ~ 7140882 (+) True XLOC_008308
TCONS_00018758 lncRNA downstream 1615821 7734489 ~ 7737531 (+) True XLOC_008311
TCONS_00016670 mRNA upstream 99582 5973909 ~ 6017920 (+) False XLOC_008295
TCONS_00016671 mRNA upstream 103185 5973967 ~ 6014317 (+) True XLOC_008295
TCONS_00016669 mRNA upstream 158699 5923992 ~ 5958803 (+) True XLOC_008294
TCONS_00016668 mRNA upstream 170717 5923851 ~ 5946785 (+) False XLOC_008294
TCONS_00016667 mRNA upstream 173657 5923851 ~ 5943845 (+) False XLOC_008294
TCONS_00016675 mRNA downstream 341179 6459847 ~ 6481984 (+) False XLOC_008298
TCONS_00016676 mRNA downstream 341179 6459847 ~ 6493615 (+) True XLOC_008298
TCONS_00016678 mRNA downstream 533728 6652396 ~ 6666303 (+) False XLOC_008300
TCONS_00016679 mRNA downstream 542675 6661343 ~ 6666232 (+) True XLOC_008300
TCONS_00016682 mRNA downstream 655208 6773876 ~ 6784279 (+) False XLOC_008303
TCONS_00016665 other upstream 262277 5855111 ~ 5855225 (+) True XLOC_008292
TCONS_00016634 other upstream 2611079 3506309 ~ 3506423 (+) True XLOC_008259
TCONS_00016623 other upstream 3431796 2685055 ~ 2685706 (+) True XLOC_008246
TCONS_00016622 other upstream 3442912 2673935 ~ 2674590 (+) True XLOC_008245
TCONS_00016611 other upstream 3758877 2358511 ~ 2358625 (+) True XLOC_008239
TCONS_00016677 other downstream 440382 6559050 ~ 6559185 (+) True XLOC_008299
TCONS_00016680 other downstream 559853 6678521 ~ 6727082 (+) True XLOC_008301
TCONS_00016681 other downstream 651918 6770586 ~ 6772120 (+) True XLOC_008302
TCONS_00016699 other downstream 2564154 8682822 ~ 8682937 (+) True XLOC_008317
TCONS_00016700 other downstream 2613084 8731752 ~ 8731866 (+) True XLOC_008318