RNA id: TCONS_00016691



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00016691
length 142
lncRNA type lincRNA
GC content 0.30
exon number 1
gene id XLOC_008312
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 7805779 ~ 7805920 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


aaaaaaaaaaaaaaaattgttgaatgaacatgatttaatcgtggcaccctttatgcatctaatccaatcaagtaaacctgaactgctttgaacatgttgtatgaacacaaagcacatttgtagataaaacatggtttcaata

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000156896

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018758 lncRNA upstream 68248 7734489 ~ 7737531 (+) True XLOC_008311
TCONS_00018757 lncRNA upstream 664897 7140410 ~ 7140882 (+) True XLOC_008308
TCONS_00018888 lncRNA upstream 930231 6867276 ~ 6875548 (+) True XLOC_008306
TCONS_00018756 lncRNA upstream 1019724 6785649 ~ 6786055 (+) True XLOC_008304
TCONS_00018887 lncRNA upstream 1645276 6159009 ~ 6160503 (+) True XLOC_008297
TCONS_00018889 lncRNA downstream 956554 8762474 ~ 8764113 (+) False XLOC_008319
TCONS_00016701 lncRNA downstream 956660 8762580 ~ 8765029 (+) True XLOC_008319
TCONS_00016708 lncRNA downstream 1399344 9205264 ~ 9211131 (+) True XLOC_008325
TCONS_00016715 lncRNA downstream 1608233 9414153 ~ 9418151 (+) True XLOC_008329
TCONS_00016716 lncRNA downstream 1646058 9451978 ~ 9457382 (+) True XLOC_008330
TCONS_00016690 mRNA upstream 615596 7187228 ~ 7190183 (+) True XLOC_008310
TCONS_00016689 mRNA upstream 626914 7176182 ~ 7178865 (+) True XLOC_008309
TCONS_00016687 mRNA upstream 643902 7064819 ~ 7161877 (+) False XLOC_008308
TCONS_00016688 mRNA upstream 643902 7086327 ~ 7161877 (+) False XLOC_008308
TCONS_00016686 mRNA upstream 747565 7057050 ~ 7058214 (+) True XLOC_008307
TCONS_00016692 mRNA downstream 186986 7992906 ~ 8151485 (+) False XLOC_008313
TCONS_00016693 mRNA downstream 237831 8043751 ~ 8151371 (+) True XLOC_008313
TCONS_00016694 mRNA downstream 386795 8192715 ~ 8234946 (+) False XLOC_008314
TCONS_00016695 mRNA downstream 386800 8192720 ~ 8235529 (+) True XLOC_008314
TCONS_00016696 mRNA downstream 529680 8335600 ~ 8381511 (+) False XLOC_008315
TCONS_00016681 other upstream 1033659 6770586 ~ 6772120 (+) True XLOC_008302
TCONS_00016680 other upstream 1078697 6678521 ~ 6727082 (+) True XLOC_008301
TCONS_00016677 other upstream 1246594 6559050 ~ 6559185 (+) True XLOC_008299
TCONS_00016665 other upstream 1950554 5855111 ~ 5855225 (+) True XLOC_008292
TCONS_00016634 other upstream 4299356 3506309 ~ 3506423 (+) True XLOC_008259
TCONS_00016699 other downstream 876902 8682822 ~ 8682937 (+) True XLOC_008317
TCONS_00016700 other downstream 925832 8731752 ~ 8731866 (+) True XLOC_008318
TCONS_00016703 other downstream 1233130 9039050 ~ 9039164 (+) True XLOC_008321
TCONS_00016712 other downstream 1497889 9303809 ~ 9311478 (+) True XLOC_008326
TCONS_00016719 other downstream 2089938 9895858 ~ 9895986 (+) True XLOC_008335

Expression Profile


//