RNA id: TCONS_00016737


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00016737
length 453
RNA type mRNA
GC content 0.53
exon number 3
gene id XLOC_008347
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 11814969 ~ 11820549 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CAGTTTCCTGAATGCGGCTTTTATGGGATCTATGACAAGATCCTCCTGTTCAAGCACGACACCAGTAGCAATAACATCCTGCAGCTGGTCAAGGCAGTGTCCGACATCCAGGAGGGAGATCTGGTGGAGGTCGTCCTATCCGCTGCTGCCACGTTTGAAGATTTCCAGATTCGTCCACATGCGTTAAATGTGCACTCCTATCGTGCACCTGCATTCTGTGATCACTGCGGCGAGATGCTTTTCGGCCTGGTGCGTCAAGGTCTCAAATGCGATGGGTGTGGACTGAACTATCACAAACGCTGTGCCTTCAGCATCCCCAATAACTGCAGCGGTGCGAGAAAAAGGCGTCTGTCCACCACGTCCCTGACCAGCAGTCAGTCTCTGCGTCTGTCCACAACCGAGTCCCTTAGTAGCCTCAACAGCAGCATGACGTCTGAAGAAGCCAGCCTCATC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000127248

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00016733 lncRNA upstream 123509 11683089 ~ 11691460 (+) False XLOC_008345
TCONS_00016734 lncRNA upstream 128185 11683120 ~ 11686784 (+) True XLOC_008345
TCONS_00016728 lncRNA upstream 509895 11303325 ~ 11305074 (+) True XLOC_008340
TCONS_00016727 lncRNA upstream 948409 10863850 ~ 10866560 (+) False XLOC_008339
TCONS_00018761 lncRNA upstream 948409 10864010 ~ 10866560 (+) True XLOC_008339
TCONS_00016741 lncRNA downstream 161901 11982450 ~ 11985783 (+) False XLOC_008350
TCONS_00018892 lncRNA downstream 161901 11982450 ~ 11986634 (+) False XLOC_008350
TCONS_00016742 lncRNA downstream 162472 11983021 ~ 11985807 (+) False XLOC_008350
TCONS_00016743 lncRNA downstream 162472 11983021 ~ 11986634 (+) False XLOC_008350
TCONS_00016744 lncRNA downstream 162597 11983146 ~ 11985958 (+) False XLOC_008350
TCONS_00016736 mRNA upstream 57322 11693624 ~ 11757647 (+) False XLOC_008346
TCONS_00016735 mRNA upstream 57322 11693624 ~ 11757647 (+) True XLOC_008346
TCONS_00016732 mRNA upstream 143796 11643659 ~ 11671173 (+) True XLOC_008344
TCONS_00016730 mRNA upstream 371755 11427620 ~ 11443214 (+) True XLOC_008342
TCONS_00016729 mRNA upstream 420647 11381532 ~ 11394322 (+) True XLOC_008341
TCONS_00016738 mRNA downstream 4817 11825366 ~ 11870530 (+) False XLOC_008348
TCONS_00016739 mRNA downstream 19762 11840311 ~ 11875820 (+) True XLOC_008348
TCONS_00016740 mRNA downstream 63255 11883804 ~ 11909082 (+) True XLOC_008349
TCONS_00016751 mRNA downstream 209818 12030367 ~ 12054746 (+) True XLOC_008352
TCONS_00016752 mRNA downstream 557338 12377887 ~ 12388434 (+) True XLOC_008354
TCONS_00016731 other upstream 249460 11565391 ~ 11565509 (+) True XLOC_008343
TCONS_00016719 other upstream 1918983 9895858 ~ 9895986 (+) True XLOC_008335
TCONS_00016712 other upstream 2503491 9303809 ~ 9311478 (+) True XLOC_008326
TCONS_00016703 other upstream 2775805 9039050 ~ 9039164 (+) True XLOC_008321
TCONS_00016700 other upstream 3083103 8731752 ~ 8731866 (+) True XLOC_008318
TCONS_00016757 other downstream 1704325 13524874 ~ 13524988 (+) True XLOC_008360
TCONS_00016758 other downstream 2137173 13957722 ~ 13957850 (+) True XLOC_008361
TCONS_00016791 other downstream 3573693 15394242 ~ 15401640 (+) True XLOC_008381
TCONS_00016809 other downstream 4698418 16518967 ~ 16519083 (+) True XLOC_008398
TCONS_00016813 other downstream 5009213 16829762 ~ 16829876 (+) True XLOC_008400

Expression Profile

//