RNA id: TU268677


Basic Information

Item Value
RNA id TU268677
length 18386
lncRNA type sense_over
GC content 0.36
exon number 2
gene id G236887
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000054
NCBI id null
chromosome length 13006764
location 12111629 ~ 12170392 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Function

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TU268676 lncRNA upstream 204246 11898230 ~ 11907383 (+) True G236886
TU268767 lncRNA upstream 255866 11854973 ~ 11855763 (+) True G236972
TU268732 lncRNA upstream 359902 11751514 ~ 11751727 (+) True G236942
TU268811 lncRNA downstream 54204 12224596 ~ 12225316 (+) True G237015
TU268813 lncRNA downstream 55284 12225676 ~ 12226328 (+) True G237016
TU268669 lncRNA downstream 139063 12309455 ~ 12310013 (+) True G236879
TU268846 lncRNA downstream 147920 12320312 ~ 12320602 (+) False G237041
TU268848 lncRNA downstream 147920 12320312 ~ 12320602 (+) True G237041
CI01000054_12097635_12100640.mRNA mRNA upstream 10989 12097436 ~ 12100640 (+) True CI01000054_12097635_12100640
CI01000054_12081184_12095030.mRNA mRNA upstream 16129 12080748 ~ 12095500 (+) True CI01000054_12081184_12095030
CI01000054_12064156_12077740.mRNA mRNA upstream 33781 12063779 ~ 12077848 (+) True CI01000054_12064156_12077740
CI01000054_12049115_12062566.mRNA mRNA upstream 49063 12049115 ~ 12062566 (+) True CI01000054_12049115_12062566
CI01000054_12039863_12047999.mRNA mRNA upstream 63630 12039863 ~ 12047999 (+) True CI01000054_12039863_12047999
CI01000054_12191048_12211237.mRNA mRNA downstream 19130 12189522 ~ 12211237 (+) True CI01000054_12191048_12211237
CI01000054_12296634_12299462.mRNA mRNA downstream 126242 12296634 ~ 12299548 (+) True CI01000054_12296634_12299462
CI01000054_12318711_12319755.mRNA mRNA downstream 148319 12318711 ~ 12319970 (+) False CI01000054_12318711_12319755
CI01000054_12321079_12339203.mRNA mRNA downstream 150687 12321079 ~ 12339203 (+) True CI01000054_12321079_12339203
CI01000054_12524575_12697096.mRNA mRNA downstream 354183 12524575 ~ 12697096 (+) True CI01000054_12524575_12697096
TU268664 other upstream 295154 11813688 ~ 11816475 (+) True G236874
TU268594 other upstream 462604 11647979 ~ 11649025 (+) False CI01000054_11648262_11648786
TU268595 other upstream 462604 11647979 ~ 11649025 (+) True CI01000054_11648262_11648786
TU268596 other upstream 477565 11632976 ~ 11634064 (+) True CI01000054_11633235_11635069
TU267998 other upstream 542630 11564976 ~ 11565121 (+) True G236317
TU269301 other downstream 714510 12884902 ~ 12886503 (+) False G237398
TU269302 other downstream 714510 12884902 ~ 12886503 (+) True G237398

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