RNA id: TCONS_00016758



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00016758
length 129
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_008361
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 13957722 ~ 13957850 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ggtggcagtgctaaccactgcctGTGTATCATAACTGTTTCAAAATGaagctcactgaagctaagcagtgctgtgcctggtcagtacctggacgggagaccacatgggaaagttaggttactgccagaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000164828

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00016756 lncRNA upstream 448354 13421514 ~ 13509368 (+) False XLOC_008359
TCONS_00018763 lncRNA upstream 448404 13505699 ~ 13509318 (+) True XLOC_008359
TCONS_00018908 lncRNA upstream 821258 13001197 ~ 13136464 (+) False XLOC_008358
TCONS_00018907 lncRNA upstream 866488 13001193 ~ 13091234 (+) False XLOC_008358
TCONS_00016760 lncRNA downstream 87271 14045121 ~ 14053466 (+) True XLOC_008363
TCONS_00016763 lncRNA downstream 183205 14141055 ~ 14141992 (+) False XLOC_008365
TCONS_00018910 lncRNA downstream 291539 14249389 ~ 14249929 (+) True XLOC_008368
TCONS_00016776 lncRNA downstream 897039 14854889 ~ 14855766 (+) False XLOC_008373
TCONS_00016777 lncRNA downstream 898346 14856196 ~ 14857945 (+) False XLOC_008373
TCONS_00016754 mRNA upstream 1498387 12435975 ~ 12459335 (+) False XLOC_008355
TCONS_00016755 mRNA upstream 1502993 12436220 ~ 12454729 (+) True XLOC_008355
TCONS_00016753 mRNA upstream 1505988 12429206 ~ 12451734 (+) False XLOC_008355
TCONS_00016752 mRNA upstream 1569288 12377887 ~ 12388434 (+) True XLOC_008354
TCONS_00016751 mRNA upstream 1902976 12030367 ~ 12054746 (+) True XLOC_008352
TCONS_00016759 mRNA downstream 27029 13984879 ~ 13986761 (+) True XLOC_008362
TCONS_00016761 mRNA downstream 151802 14109652 ~ 14120431 (+) True XLOC_008364
TCONS_00016762 mRNA downstream 183195 14141045 ~ 14147349 (+) False XLOC_008365
TCONS_00016764 mRNA downstream 187496 14145346 ~ 14173592 (+) False XLOC_008365
TCONS_00016765 mRNA downstream 196324 14154174 ~ 14163546 (+) True XLOC_008366
TCONS_00016757 other upstream 432734 13524874 ~ 13524988 (+) True XLOC_008360
TCONS_00016731 other upstream 2392213 11565391 ~ 11565509 (+) True XLOC_008343
TCONS_00016719 other upstream 4061736 9895858 ~ 9895986 (+) True XLOC_008335
TCONS_00016712 other upstream 4646244 9303809 ~ 9311478 (+) True XLOC_008326
TCONS_00016703 other upstream 4918558 9039050 ~ 9039164 (+) True XLOC_008321
TCONS_00016791 other downstream 1436392 15394242 ~ 15401640 (+) True XLOC_008381
TCONS_00016809 other downstream 2561117 16518967 ~ 16519083 (+) True XLOC_008398
TCONS_00016813 other downstream 2871912 16829762 ~ 16829876 (+) True XLOC_008400
TCONS_00016824 other downstream 3142627 17100477 ~ 17101668 (+) False XLOC_008406
TCONS_00016835 other downstream 3415939 17373789 ~ 17373915 (+) True XLOC_008411