RNA id: TCONS_00018933


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00018933
length 43650
lncRNA type inter_gene
GC content 0.35
exon number 5
gene id XLOC_008467
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 21323046 ~ 21495896 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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TCONS_00018941 lncRNA downstream 56033 21446241 ~ 21492008 (+) False XLOC_008467
TCONS_00018942 lncRNA downstream 56033 21446241 ~ 21495896 (+) False XLOC_008467
TCONS_00016951 mRNA upstream 2439 21276735 ~ 21320638 (+) True XLOC_008466
TCONS_00016949 mRNA upstream 47394 21262917 ~ 21275683 (+) False XLOC_008465
TCONS_00016948 mRNA upstream 62157 21254800 ~ 21260920 (+) True XLOC_008464
TCONS_00016947 mRNA upstream 64753 21252617 ~ 21258324 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016946 mRNA upstream 65241 21252598 ~ 21257836 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016956 mRNA downstream 282073 21672281 ~ 21673630 (+) False XLOC_008471
TCONS_00016957 mRNA downstream 282492 21672700 ~ 21673452 (+) True XLOC_008471
TCONS_00016959 mRNA downstream 317692 21707900 ~ 21715436 (+) False XLOC_008472
TCONS_00016961 mRNA downstream 321463 21711671 ~ 21717167 (+) False XLOC_008472
TCONS_00016962 mRNA downstream 322120 21712328 ~ 21719970 (+) True XLOC_008472
TCONS_00016942 other upstream 61885 21252579 ~ 21261192 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016937 other upstream 70795 21252191 ~ 21252282 (+) True XLOC_008463
TCONS_00016935 other upstream 124791 21180094 ~ 21198286 (+) True XLOC_008459
TCONS_00016934 other upstream 146028 21167142 ~ 21177049 (+) True XLOC_008458
TCONS_00016921 other upstream 787593 20529280 ~ 20535484 (+) False XLOC_008450
TCONS_00016953 other downstream 47425 21437633 ~ 21437728 (+) True XLOC_008468
TCONS_00016954 other downstream 47668 21437876 ~ 21437959 (+) True XLOC_008469
TCONS_00016955 other downstream 57448 21447656 ~ 21447800 (+) True XLOC_008467
TCONS_00016960 other downstream 321452 21711660 ~ 21715665 (+) False XLOC_008472
TCONS_00016964 other downstream 377316 21767524 ~ 21770009 (+) True XLOC_008473

Expression Profile

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