RNA id: TCONS_00017063



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00017063
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_008536
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 25469729 ~ 25469845 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


acccacagccatatcaccctgcagcccaagactggttactcactgaagctaagcagggctgagtctggccagtatctggatgggagaccacactggaaaactaggttgctgttgtag

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177143

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018971 lncRNA upstream 70155 25395901 ~ 25399574 (+) True XLOC_008533
TCONS_00018968 lncRNA upstream 92235 25370567 ~ 25377494 (+) False XLOC_008532
TCONS_00018969 lncRNA upstream 92235 25370731 ~ 25377494 (+) False XLOC_008532
TCONS_00018970 lncRNA upstream 92235 25370791 ~ 25377494 (+) True XLOC_008532
TCONS_00018967 lncRNA upstream 259887 25208392 ~ 25209842 (+) True XLOC_008531
TCONS_00017066 lncRNA downstream 58464 25528309 ~ 25529425 (+) True XLOC_008538
TCONS_00018972 lncRNA downstream 99092 25568937 ~ 25570599 (+) True XLOC_008539
TCONS_00018973 lncRNA downstream 426620 25896465 ~ 25902650 (+) False XLOC_008543
TCONS_00018974 lncRNA downstream 1206140 26675985 ~ 26680699 (+) True XLOC_008549
TCONS_00017087 lncRNA downstream 1826831 27296676 ~ 27300833 (+) True XLOC_008552
TCONS_00017060 mRNA upstream 21103 25438714 ~ 25448626 (+) False XLOC_008534
TCONS_00017061 mRNA upstream 26704 25439106 ~ 25443025 (+) True XLOC_008534
TCONS_00017057 mRNA upstream 300116 25156121 ~ 25169613 (+) False XLOC_008530
TCONS_00017058 mRNA upstream 300116 25156382 ~ 25169613 (+) False XLOC_008530
TCONS_00017059 mRNA upstream 300185 25158104 ~ 25169544 (+) True XLOC_008530
TCONS_00017064 mRNA downstream 19561 25489406 ~ 25499518 (+) True XLOC_008537
TCONS_00017065 mRNA downstream 58445 25528290 ~ 25542592 (+) False XLOC_008538
TCONS_00017067 mRNA downstream 165481 25635326 ~ 25656327 (+) False XLOC_008540
TCONS_00017068 mRNA downstream 165481 25635326 ~ 25656331 (+) False XLOC_008540
TCONS_00017069 mRNA downstream 165482 25635327 ~ 25656327 (+) False XLOC_008540
TCONS_00017050 other upstream 507477 24962136 ~ 24962252 (+) True XLOC_008523
TCONS_00017035 other upstream 786439 24676913 ~ 24683290 (+) False XLOC_008517
TCONS_00017027 other upstream 900667 24563768 ~ 24569062 (+) False XLOC_008513
TCONS_00016993 other upstream 2019043 23446189 ~ 23450686 (+) True XLOC_008495
TCONS_00016990 other upstream 2091541 23378071 ~ 23378188 (+) True XLOC_008494
TCONS_00017070 other downstream 165496 25635341 ~ 25656331 (+) True XLOC_008540
TCONS_00017071 other downstream 197742 25667587 ~ 25667701 (+) True XLOC_008541
TCONS_00017074 other downstream 427601 25897446 ~ 25897539 (+) False XLOC_008543
TCONS_00017075 other downstream 427870 25897715 ~ 25897799 (+) True XLOC_008543
TCONS_00017076 other downstream 636470 26106315 ~ 26106433 (+) True XLOC_008544

Expression Profile


//