RNA id: TU312228


Basic Information

Item Value
RNA id TU312228
length 15573
lncRNA type inter_gene
GC content 0.38
exon number 2
gene id G275191
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000069
NCBI id null
chromosome length 5329268
location 1283491 ~ 1299129 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU312221 lncRNA downstream 42882 1237987 ~ 1240609 (-) True G275184
TU312216 lncRNA downstream 159194 1120362 ~ 1124297 (-) True G275179
TU312213 lncRNA downstream 197100 1085650 ~ 1086391 (-) True CI01000069_01085974_01097576
TU312235 lncRNA downstream 251513 1027973 ~ 1031978 (-) True G275198
TU312206 lncRNA downstream 264045 1015167 ~ 1019446 (-) True G275169
TU312226 lncRNA upstream 44307 1343436 ~ 1349224 (-) True G275189
TU312225 lncRNA upstream 71927 1371056 ~ 1381154 (-) True G275188
TU312232 lncRNA upstream 92694 1391823 ~ 1395183 (-) True G275195
TU312326 lncRNA upstream 121282 1420411 ~ 1420848 (-) True G275276
TU312334 lncRNA upstream 151281 1450410 ~ 1450722 (-) True G275284
CI01000069_01155772_01178120.mRNA mRNA downstream 105371 1155442 ~ 1178120 (-) True CI01000069_01155772_01178120
CI01000069_01141607_01144384.mRNA mRNA downstream 138670 1141470 ~ 1144821 (-) True CI01000069_01141607_01144384
CI01000069_01085974_01097576.mRNA mRNA downstream 185915 1085665 ~ 1097576 (-) False CI01000069_01085974_01097576
CI01000069_01052717_01076129.mRNA mRNA downstream 207362 1052208 ~ 1076129 (-) True CI01000069_01052717_01076129
CI01000069_01023405_01025613.mRNA mRNA downstream 257433 1023342 ~ 1026058 (-) True CI01000069_01023405_01025613
CI01000069_01410825_01412802.mRNA mRNA upstream 111458 1410587 ~ 1413155 (-) True CI01000069_01410825_01412802
CI01000069_01519314_01531186.mRNA mRNA upstream 220072 1519201 ~ 1531586 (-) True CI01000069_01519314_01531186
CI01000069_01571371_01593400.mRNA mRNA upstream 272242 1571371 ~ 1593400 (-) True CI01000069_01571371_01593400
CI01000069_01632361_01633951.mRNA mRNA upstream 333095 1632224 ~ 1633951 (-) True CI01000069_01632361_01633951
CI01000069_01645966_01647142.mRNA mRNA upstream 345393 1644522 ~ 1647142 (-) False CI01000069_01645966_01647142
TU312233 other downstream 327701 813235 ~ 954003 (-) True G275196
TU312215 other downstream 337687 926923 ~ 945804 (-) True G275178
TU310316 other downstream 1236277 46896 ~ 47214 (-) False G273476
TU310319 other downstream 1236322 46896 ~ 47169 (-) True G273476
TU310314 other downstream 1240119 41656 ~ 43372 (-) False CI01000069_00041648_00043198
TU312389 other upstream 346639 1645768 ~ 1647326 (-) True CI01000069_01645966_01647142
TU312710 other upstream 1312046 2621752 ~ 2630247 (-) False G275624
TU312711 other upstream 1312046 2621752 ~ 2630316 (-) True G275624
TU312760 other upstream 1689897 2989026 ~ 2991817 (-) True G275668
TU312791 other upstream 1693375 2992504 ~ 3078168 (-) True G275699

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