RNA id: TCONS_00017504


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00017504
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_008837
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 47322860 ~ 47322976 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aaccacagccatatcaccctgcagcccaagagcgctccctcactgaagctgagcagggctgaggctggtcagtgtctggatgggagagcacatgggaacactaggctgctgtagaca

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119402

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00019087 lncRNA upstream 25315 47296044 ~ 47297545 (+) True XLOC_008836
TCONS_00017498 lncRNA upstream 516580 46801341 ~ 46806280 (+) True XLOC_008831
TCONS_00017496 lncRNA upstream 521676 46799469 ~ 46801184 (+) False XLOC_008830
TCONS_00017497 lncRNA upstream 521676 46799635 ~ 46801184 (+) True XLOC_008830
TCONS_00017495 lncRNA upstream 577671 46695492 ~ 46745189 (+) True XLOC_008829
TCONS_00017514 lncRNA downstream 286346 47609322 ~ 47614730 (+) False XLOC_008846
TCONS_00017513 lncRNA downstream 286346 47609322 ~ 47614730 (+) True XLOC_008846
TCONS_00017516 lncRNA downstream 398897 47721873 ~ 47725335 (+) True XLOC_008848
TCONS_00018802 lncRNA downstream 423925 47746901 ~ 47747895 (+) True XLOC_008850
TCONS_00017519 lncRNA downstream 505743 47828719 ~ 47831416 (+) True XLOC_008851
TCONS_00017503 mRNA upstream 146709 47161917 ~ 47176151 (+) True XLOC_008835
TCONS_00017502 mRNA upstream 234436 47083163 ~ 47088424 (+) True XLOC_008834
TCONS_00017501 mRNA upstream 247600 47008307 ~ 47075260 (+) True XLOC_008833
TCONS_00017499 mRNA upstream 409785 46853252 ~ 46913075 (+) False XLOC_008832
TCONS_00017500 mRNA upstream 435238 46853505 ~ 46887622 (+) True XLOC_008832
TCONS_00017505 mRNA downstream 18880 47341856 ~ 47350232 (+) True XLOC_008838
TCONS_00017506 mRNA downstream 39752 47362728 ~ 47385012 (+) True XLOC_008839
TCONS_00017507 mRNA downstream 63963 47386939 ~ 47411807 (+) True XLOC_008840
TCONS_00017508 mRNA downstream 95589 47418565 ~ 47421836 (+) True XLOC_008841
TCONS_00017509 mRNA downstream 117501 47440477 ~ 47449248 (+) True XLOC_008842
TCONS_00017492 other upstream 727280 46595466 ~ 46595580 (+) True XLOC_008826
TCONS_00017473 other upstream 1673079 45643787 ~ 45649781 (+) False XLOC_008809
TCONS_00017470 other upstream 1705564 45617016 ~ 45617296 (+) True XLOC_008808
TCONS_00017469 other upstream 1708291 45614290 ~ 45614569 (+) True XLOC_008807
TCONS_00017459 other upstream 2461461 44861283 ~ 44861399 (+) True XLOC_008797

Expression Profile

//