RNA id: TCONS_00018452


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00018452
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_009383
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 34279421 ~ 34279535 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCTGCAGCTAGCTGTCTGccactctcacatggtcgccaactgaagctaagcagggctgtgcctggtcaatacctggatggAAGACTACATggtaaagctaggttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190577

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018440 lncRNA downstream 314510 33957926 ~ 33964911 (-) True XLOC_009379
TCONS_00018427 lncRNA downstream 391754 33879353 ~ 33887667 (-) True XLOC_009376
TCONS_00018426 lncRNA downstream 392058 33875205 ~ 33887363 (-) False XLOC_009376
TCONS_00019210 lncRNA downstream 392071 33879353 ~ 33887350 (-) False XLOC_009376
TCONS_00018425 lncRNA downstream 393268 33868661 ~ 33886153 (-) False XLOC_009376
TCONS_00018835 lncRNA upstream 188848 34468383 ~ 34478448 (-) True XLOC_009385
TCONS_00018836 lncRNA upstream 322987 34602522 ~ 34607406 (-) True XLOC_009389
TCONS_00019211 lncRNA upstream 379346 34658881 ~ 34668392 (-) True XLOC_009390
TCONS_00018496 lncRNA upstream 1134931 35414466 ~ 35661368 (-) False XLOC_009404
TCONS_00018837 lncRNA upstream 1137089 35416624 ~ 35661131 (-) False XLOC_009404
TCONS_00018445 mRNA downstream 64981 34172371 ~ 34214440 (-) False XLOC_009381
TCONS_00018446 mRNA downstream 65431 34177164 ~ 34213990 (-) False XLOC_009381
TCONS_00018447 mRNA downstream 65523 34177189 ~ 34213898 (-) True XLOC_009381
TCONS_00018444 mRNA downstream 222542 34052737 ~ 34056879 (-) True XLOC_009380
TCONS_00018441 mRNA downstream 222688 33994575 ~ 34056733 (-) False XLOC_009380
TCONS_00018453 mRNA upstream 55187 34334722 ~ 34418525 (-) False XLOC_009384
TCONS_00018454 mRNA upstream 74591 34354126 ~ 34408777 (-) True XLOC_009384
TCONS_00018455 mRNA upstream 148773 34428308 ~ 34458495 (-) False XLOC_009385
TCONS_00018456 mRNA upstream 149184 34428719 ~ 34468599 (-) False XLOC_009385
TCONS_00018457 mRNA upstream 215521 34495056 ~ 34568705 (-) False XLOC_009386
TCONS_00018421 other downstream 545315 33706680 ~ 33734106 (-) True XLOC_009372
TCONS_00018418 other downstream 616249 33663055 ~ 33663172 (-) True XLOC_009370
TCONS_00018399 other downstream 2216012 32063292 ~ 32063409 (-) True XLOC_009362
TCONS_00018396 other downstream 2731569 31547734 ~ 31547852 (-) True XLOC_009360
TCONS_00018378 other downstream 2917280 31361787 ~ 31362141 (-) True XLOC_009348
TCONS_00018481 other upstream 815670 35095205 ~ 35112786 (-) False XLOC_009398
TCONS_00018488 other upstream 887760 35167295 ~ 35212237 (-) True XLOC_009400
TCONS_00018513 other upstream 2249930 36529465 ~ 36533247 (-) True XLOC_009417
TCONS_00018517 other upstream 2594716 36874251 ~ 36874366 (-) True XLOC_009420
TCONS_00018535 other upstream 3448299 37727834 ~ 37729166 (-) True XLOC_009432