RNA id: TU426905


Basic Information

Item Value
RNA id TU426905
length 2946
RNA type TUCP
GC content 0.41
exon number 2
gene id G373731
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000176
NCBI id null
chromosome length 156485
location 54957 ~ 65835 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

GCACCTGTAATCAACACATTCAAGGTCCAGAAAGGTACTAAAGACATCGTTAAAACAGTCACATGACTGCAGTGGTTCAACCTTAATGTTATGAAGAGACAAGAATACTTTTGTGTGCAAAAACAAAACAAAAATAACGACTTTATTCAACTCTTCTGTGTGATTCTCATACGCTGTTTACATTCAGCACTTCCAGGTTCTACATCAGAACGCCAGATCAGTATTGGCAGAGGCTGATCACGTGATCAGCATGATGCATGCGTGTGATGCTGATGCAGGAGCCGGCCAATAATGAGTCGCCGTTCTGACGTAGAGCCTGGAAGATGAAAGAAGAATGGTGAAGAGTCTGCTTATAGACTGGAGGTTGAACAGCTGGCTGTCTGGTGCAGTCACAACAACCTGGAGCTGAACACGCTCAAAACAGTGGAGATGATAGTGGACTTCAGGAGGAACAGCCCAGAACTACCTCCACTCACCATCATGAACAGCACTGTGGCAGCAGTGGAGTCATTCAGGTTCCTGGGCACCACCATCTCTCAGGACCTGAAGTGGGACAATCACATTGACTCCATAGTGAAAAAGGCCCAGCAGAGGTTGTATTTCCTTCACCAGCTGAGGAAGTTCAACCTGCCACAGGAGCTGCTGAAACAGGTCTACTCAGCCATCATTGAGTCTGGCCTGTGTTCATCTATAACTACCTGGTTTGGTTCAGCCACCAAATCAGACATCAGGAGACTACAACGGACAGTCACGACGGGTGAGAAGATTATTGGTTCCCCCCTGCCCAAACTCAAAGACCTCTACACCCCCAGAGTGAGAAAAAGGGATAAAAAAAATCACTTTGGACCCCACACACCTAGCCCACTATCTCTTTGAACTTGTTGGAACATACTTAGGTATGAAAGTTTGTCATGGTCAAGTTTACCCAGTGGAAGCCAAACACAGTTTCTAGTTCCCTTAAAAAATGAGAGTTGCGACGATTTTTGGGAATGGTGGGCTACTACAGAGGATTTTGTGAGAATTTCACCACTGTAGTCTCTCCATTAACTAACCTCCTGAGTCCCTCTAAGAAGTTTATGTGGAGTGTGCTGATGCTTTTGCTGCTGCAAAGTACATTATGTGTAATGCCCCTGTGCTTGCTGCCCCAAACTTCACCCTGCCTTTTAAACTACAGATTGATGCCAGTGCAACTGGGGTTCCCCAGTGTTAGTTTATACCGACCACAATCCCCTAATCTTCTTATCTCGAATGTGCAAGTCCTTCATTGTGCAAGAGTAGGGCTCAGAAAATGTAATGGCGGATGCGCTGTCCAATACCAATAGTGACAGACAGCTGATCTGTGAATTTTTAACAGGTTTGTACAATTACGGTGGTAGTCTGTAATTTATGGGTGAGAGTGTTACGTCCCAGGACATATGTCAATTATTGTTGTTAGTTTTGTGAATATATGTGTGTGATTGTGTTTCCCTGATGTCCAGCAGCCTGCTGGGAGGTGTAGTTTATGCCTGTTTTCCTCTGTTCCTCCCTCACAGGAGCCTAACTGATGCCACCTGTTCCTCATCAGAGTTTGTGGAGAGGAGCTTGCATTTAAACACAGGAAGAGAGAGTGTGGCCTGTCTGCTTTCCCAGACTTTGTTGGACGTTGTGGGCTCTGAGCCTTAAAGCTTCTTTAAGAAAGCCTGTTGTATCTGCTGTAGTGGAGGAGAAAGCTTGGTGTGTAATAGCCCCATTATTGTTGCCTGCAGATGCAGTAAGGAGGCCGTGCCACTGTTGTTTCTACTAACACCTGCTTTTCTCCAGTTTTTGGGATAGTAAGGTAGTCAGGGGAGAGATCTGTTGTTTACTTTGATTTTTTGTTTGATAGGTTAATTAGATTCCCTTAGTCCCAGGTAGCTTACACCTTTTGTTTGTTATTTTGGTTCCTGAAGCATCTTATCATAATTTCTTTTTGAGTTATCATTACTGTTATCAGCTTTATTCTTAACTGCTGTAAAAGAGTCTTTGTAAATAAAAGCTTGAAGAGTTTCCCCGTATGTGTGGCGAGTGCTGGGATTGCAGACAGAACCAACTCTCTCATTTTTGCCCTGTTTTTCATGGGGATACGTTTTCTTTCCTTTTAAACAATATGTTACTTCCCTGCCACCCCTAGACAAAAAGGGAATGTAACAATTAACTACCATTTCTGTATATTTGTACACAAAATCTAAAATTCTACATCTGTAAATTTCATCATAAACTGTACACTTGTACTTAATCTGTACATTCGTTATTTATTTATTTCTACTACTTGTTTATATTGCTTTATTTAAATAAATATTGTTATATATAATTTCTACTGTGTAATTCCAAAAGGCACCGAATCCCATGAATGACCCACATAACTTCAATTTAATGTGCAGATCATTGTCAGACATAGTTTTAAAGTAGCCTGTATTTGTCAGGTATATTGAAAACACAAAACTCAACCACAGCTTCTTTTAGCTGTTATTAAAATCTTACTGAAAACATGACGGTGCAGGGCAAGAAATTACCATTATTTTCCTCAGTTCATGTGAGCTTAACTGATTCATGAACGTTATAATAAAACAACCGTGTCGTTTAGGTGGTTGTAGCTGACGGTTATTTTCACATTCGTAGCTACACCTCTAAAATTCAAGGTTATTTTTGATTTAGAAAAAGACGGAGAAAGTTTGCTGTGAGCGGGTGTTATCCTGTAGGAGGCGCTCTGACGCTCTTCAGTCCGCCGGTAAAACCATGAAGAAAAAACGAAGACTGCTGCACTGAGGTGTGTATTTGAACTGTTTATGTGACTTTAGTGTTTTAAAGAGCTTAAATGAAGCGTTTCCTCACTGTTTATCCTTAATATAGAATTAACCATGATTCTATTGCATAGTTCAACTTAGGTGTTTGTAATAAAATCATAGTAAACAGATTTACCATTATTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU426878 lncRNA downstream 8008 31747 ~ 46949 (-) False G373722
TU426880 lncRNA downstream 8008 37663 ~ 46949 (-) True G373722
TU426874 lncRNA downstream 11070 31747 ~ 43887 (-) False G373722
TU426907 lncRNA upstream 26956 92791 ~ 93175 (-) True G373733
TU426942 lncRNA upstream 74347 140182 ~ 140538 (-) False G373759
TU426944 lncRNA upstream 74347 140182 ~ 140746 (-) True G373759
CI01000176_00007025_00017149.mRNA mRNA downstream 37658 6744 ~ 17299 (-) True CI01000176_00007025_00017149
TU426886 other downstream 6076 31747 ~ 48881 (-) False G373722

Expression Profile