RNA id: TCONS_00018590


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00018590
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_009467
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 40069011 ~ 40069127 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaccatgTAGCCCAAaaccggttactcactaaagctaagcagagctgagtctggttagtacctggatgggagtccacatgggaaaactaggctgTTGTTGTGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177814

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00019228 lncRNA downstream 62473 40002864 ~ 40006538 (-) True XLOC_009464
TCONS_00019227 lncRNA downstream 62747 40002864 ~ 40006264 (-) False XLOC_009464
TCONS_00019226 lncRNA downstream 62748 40002864 ~ 40006263 (-) False XLOC_009464
TCONS_00019225 lncRNA downstream 62748 40002864 ~ 40006263 (-) False XLOC_009464
TCONS_00019224 lncRNA downstream 62749 40002864 ~ 40006262 (-) False XLOC_009464
TCONS_00018591 lncRNA upstream 56282 40125409 ~ 40129076 (-) False XLOC_009468
TCONS_00019229 lncRNA upstream 56282 40125409 ~ 40129541 (-) False XLOC_009468
TCONS_00018592 lncRNA upstream 59479 40128606 ~ 40129076 (-) False XLOC_009468
TCONS_00019230 lncRNA upstream 59479 40128606 ~ 40129541 (-) True XLOC_009468
TCONS_00018597 lncRNA upstream 91241 40160368 ~ 40160874 (-) False XLOC_009469
TCONS_00018588 mRNA downstream 3715 40051218 ~ 40065296 (-) False XLOC_009466
TCONS_00018589 mRNA downstream 3746 40051251 ~ 40065265 (-) True XLOC_009466
TCONS_00018587 mRNA downstream 27556 40040155 ~ 40041455 (-) True XLOC_009465
TCONS_00018585 mRNA downstream 97255 39964943 ~ 39971756 (-) False XLOC_009463
TCONS_00018586 mRNA downstream 99023 39964945 ~ 39969988 (-) True XLOC_009463
TCONS_00018593 mRNA upstream 68437 40137564 ~ 40175894 (-) False XLOC_009469
TCONS_00018594 mRNA upstream 81578 40150705 ~ 40157165 (-) False XLOC_009469
TCONS_00018595 mRNA upstream 85031 40154158 ~ 40157331 (-) False XLOC_009469
TCONS_00018596 mRNA upstream 85031 40154158 ~ 40157513 (-) False XLOC_009469
TCONS_00018599 mRNA upstream 148129 40217256 ~ 40267485 (-) False XLOC_009470
TCONS_00018535 other downstream 2339845 37727834 ~ 37729166 (-) True XLOC_009432
TCONS_00018517 other downstream 3194645 36874251 ~ 36874366 (-) True XLOC_009420
TCONS_00018513 other downstream 3535764 36529465 ~ 36533247 (-) True XLOC_009417
TCONS_00018488 other downstream 4856774 35167295 ~ 35212237 (-) True XLOC_009400
TCONS_00018481 other downstream 4956225 35095205 ~ 35112786 (-) False XLOC_009398
TCONS_00018622 other upstream 1324274 41393401 ~ 41396073 (-) True XLOC_009478
TCONS_00018633 other upstream 1460133 41529260 ~ 41543440 (-) True XLOC_009482
TCONS_00018660 other upstream 2208546 42277673 ~ 42283815 (-) True XLOC_009502
TCONS_00018661 other upstream 2459663 42528790 ~ 42528904 (-) True XLOC_009503
TCONS_00018665 other upstream 2659343 42728470 ~ 42728586 (-) True XLOC_009507