RNA id: TCONS_00019299



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00019299
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_009606
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 1220446 ~ 1220562 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


aaccacagccatatcaccctgtaaCCTGAGACCGCTTACtctctgaagctaagcagggctgagcctggtcagtaccaggatgggagaccacttggaaAAACTAGGtttctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115899

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021860 lncRNA upstream 184493 1032575 ~ 1035953 (+) True XLOC_009602
TCONS_00021671 lncRNA upstream 577537 616213 ~ 642909 (+) True XLOC_009600
TCONS_00021670 lncRNA upstream 708186 493850 ~ 512260 (+) True XLOC_009598
TCONS_00021859 lncRNA upstream 762971 432970 ~ 457475 (+) False XLOC_009599
TCONS_00021861 lncRNA downstream 175661 1396223 ~ 1398918 (+) True XLOC_009610
TCONS_00021862 lncRNA downstream 500197 1720759 ~ 1721414 (+) True XLOC_009611
TCONS_00021864 lncRNA downstream 555953 1776515 ~ 1817548 (+) False XLOC_009613
TCONS_00021863 lncRNA downstream 555953 1776515 ~ 1817548 (+) False XLOC_009613
TCONS_00021865 lncRNA downstream 639822 1860384 ~ 1861160 (+) True XLOC_009614
TCONS_00019297 mRNA upstream 9284 1199202 ~ 1211162 (+) True XLOC_009604
TCONS_00019296 mRNA upstream 43943 1100559 ~ 1176503 (+) True XLOC_009603
TCONS_00019295 mRNA upstream 402509 813780 ~ 817937 (+) False XLOC_009601
TCONS_00019294 mRNA upstream 402509 813780 ~ 817937 (+) True XLOC_009601
TCONS_00019292 mRNA upstream 990964 221739 ~ 229482 (+) True XLOC_009597
TCONS_00019300 mRNA downstream 7511 1228073 ~ 1239617 (+) True XLOC_009607
TCONS_00019301 mRNA downstream 33828 1254390 ~ 1321591 (+) True XLOC_009608
TCONS_00019302 mRNA downstream 113869 1334431 ~ 1359116 (+) False XLOC_009609
TCONS_00019303 mRNA downstream 133332 1353894 ~ 1359903 (+) True XLOC_009609
TCONS_00019304 mRNA downstream 141688 1362250 ~ 1397106 (+) False XLOC_009610
TCONS_00019298 other upstream 7658 1212674 ~ 1212788 (+) True XLOC_009605
TCONS_00019306 other downstream 520375 1740937 ~ 1741058 (+) True XLOC_009612
TCONS_00019309 other downstream 1063494 2284056 ~ 2284174 (+) True XLOC_009616
TCONS_00019314 other downstream 1508811 2729373 ~ 2729489 (+) True XLOC_009620
TCONS_00019326 other downstream 2132939 3353501 ~ 3353617 (+) True XLOC_009631
TCONS_00019348 other downstream 3477251 4697813 ~ 4707300 (+) False XLOC_009649

Expression Profile


//