RNA id: TCONS_00019306


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00019306
length 122
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_009612
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 1740937 ~ 1741058 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaccctgcagccccaAGCCCAAGCATACTCACTGAAGCtatgcagggctgagcctggttagtacctgaatgggagatgACACATGAGAAAATTAGGTTTCTGTAggta

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117111

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021862 lncRNA upstream 19523 1720759 ~ 1721414 (+) True XLOC_009611
TCONS_00021861 lncRNA upstream 342019 1396223 ~ 1398918 (+) True XLOC_009610
TCONS_00021860 lncRNA upstream 704984 1032575 ~ 1035953 (+) True XLOC_009602
TCONS_00021671 lncRNA upstream 1098028 616213 ~ 642909 (+) True XLOC_009600
TCONS_00021670 lncRNA upstream 1228677 493850 ~ 512260 (+) True XLOC_009598
TCONS_00021864 lncRNA downstream 35457 1776515 ~ 1817548 (+) False XLOC_009613
TCONS_00021863 lncRNA downstream 35457 1776515 ~ 1817548 (+) False XLOC_009613
TCONS_00021865 lncRNA downstream 119326 1860384 ~ 1861160 (+) True XLOC_009614
TCONS_00021866 lncRNA downstream 380613 2121671 ~ 2158007 (+) False XLOC_009615
TCONS_00021867 lncRNA downstream 380626 2121684 ~ 2176051 (+) True XLOC_009615
TCONS_00019305 mRNA upstream 341609 1383914 ~ 1399328 (+) False XLOC_009610
TCONS_00019304 mRNA upstream 343831 1362250 ~ 1397106 (+) False XLOC_009610
TCONS_00019303 mRNA upstream 381034 1353894 ~ 1359903 (+) True XLOC_009609
TCONS_00019302 mRNA upstream 381821 1334431 ~ 1359116 (+) False XLOC_009609
TCONS_00019301 mRNA upstream 419346 1254390 ~ 1321591 (+) True XLOC_009608
TCONS_00019307 mRNA downstream 61249 1802307 ~ 2105556 (+) False XLOC_009613
TCONS_00019308 mRNA downstream 62404 1803462 ~ 2105556 (+) True XLOC_009613
TCONS_00019310 mRNA downstream 692638 2433696 ~ 2434462 (+) True XLOC_009617
TCONS_00019311 mRNA downstream 728831 2469889 ~ 2472577 (+) True XLOC_009618
TCONS_00019313 mRNA downstream 824375 2565433 ~ 2583278 (+) False XLOC_009619
TCONS_00019299 other upstream 520375 1220446 ~ 1220562 (+) True XLOC_009606
TCONS_00019298 other upstream 528149 1212674 ~ 1212788 (+) True XLOC_009605
TCONS_00019309 other downstream 542998 2284056 ~ 2284174 (+) True XLOC_009616
TCONS_00019314 other downstream 988315 2729373 ~ 2729489 (+) True XLOC_009620
TCONS_00019326 other downstream 1612443 3353501 ~ 3353617 (+) True XLOC_009631
TCONS_00019348 other downstream 2956755 4697813 ~ 4707300 (+) False XLOC_009649
TCONS_00019354 other downstream 3029321 4770379 ~ 4779952 (+) False XLOC_009652