RNA id: TCONS_00019309


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00019309
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_009616
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 2284056 ~ 2284174 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACATACACCTATACCACCCTGAATATACCCGTTCTCATTTGatctcggaagtaaagcagggttggACCTGGTTAGTACTCGGATGGGAGACTGCCTGGGAATACCAAGTGCTGTAAGCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116049

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021867 lncRNA upstream 108005 2121684 ~ 2176051 (+) True XLOC_009615
TCONS_00021866 lncRNA upstream 126049 2121671 ~ 2158007 (+) False XLOC_009615
TCONS_00021865 lncRNA upstream 422896 1860384 ~ 1861160 (+) True XLOC_009614
TCONS_00021864 lncRNA upstream 466508 1776515 ~ 1817548 (+) False XLOC_009613
TCONS_00021863 lncRNA upstream 466508 1776515 ~ 1817548 (+) False XLOC_009613
TCONS_00021868 lncRNA downstream 769250 3053424 ~ 3059091 (+) True XLOC_009625
TCONS_00021672 lncRNA downstream 851984 3136158 ~ 3137243 (+) True XLOC_009627
TCONS_00021675 lncRNA downstream 863088 3147262 ~ 3149776 (+) False XLOC_009628
TCONS_00021674 lncRNA downstream 863088 3147262 ~ 3149776 (+) False XLOC_009628
TCONS_00021673 lncRNA downstream 863088 3147262 ~ 3149776 (+) False XLOC_009628
TCONS_00019307 mRNA upstream 178500 1802307 ~ 2105556 (+) False XLOC_009613
TCONS_00019308 mRNA upstream 178500 1803462 ~ 2105556 (+) True XLOC_009613
TCONS_00019305 mRNA upstream 884728 1383914 ~ 1399328 (+) False XLOC_009610
TCONS_00019304 mRNA upstream 886950 1362250 ~ 1397106 (+) False XLOC_009610
TCONS_00019303 mRNA upstream 924153 1353894 ~ 1359903 (+) True XLOC_009609
TCONS_00019310 mRNA downstream 149522 2433696 ~ 2434462 (+) True XLOC_009617
TCONS_00019311 mRNA downstream 185715 2469889 ~ 2472577 (+) True XLOC_009618
TCONS_00019313 mRNA downstream 281259 2565433 ~ 2583278 (+) False XLOC_009619
TCONS_00019312 mRNA downstream 281259 2565433 ~ 2583278 (+) True XLOC_009619
TCONS_00019316 mRNA downstream 536166 2820340 ~ 2833536 (+) False XLOC_009621
TCONS_00019306 other upstream 542998 1740937 ~ 1741058 (+) True XLOC_009612
TCONS_00019299 other upstream 1063494 1220446 ~ 1220562 (+) True XLOC_009606
TCONS_00019298 other upstream 1071268 1212674 ~ 1212788 (+) True XLOC_009605
TCONS_00019314 other downstream 445199 2729373 ~ 2729489 (+) True XLOC_009620
TCONS_00019326 other downstream 1069327 3353501 ~ 3353617 (+) True XLOC_009631
TCONS_00019348 other downstream 2413639 4697813 ~ 4707300 (+) False XLOC_009649
TCONS_00019354 other downstream 2486205 4770379 ~ 4779952 (+) False XLOC_009652
TCONS_00019355 other downstream 2489959 4774133 ~ 4776956 (+) True XLOC_009652