RNA id: TCONS_00019314


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00019314
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_009620
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 2729373 ~ 2729489 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCCACAGCtgtatcaccctgcagcccaagaccggttactcactgaagataagcagggctgagcctggtcagtatctggatgggatcccacatgggaaagctaggttgctgttggat

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178833

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021867 lncRNA upstream 553322 2121684 ~ 2176051 (+) True XLOC_009615
TCONS_00021866 lncRNA upstream 571366 2121671 ~ 2158007 (+) False XLOC_009615
TCONS_00021865 lncRNA upstream 868213 1860384 ~ 1861160 (+) True XLOC_009614
TCONS_00021864 lncRNA upstream 911825 1776515 ~ 1817548 (+) False XLOC_009613
TCONS_00021868 lncRNA downstream 323935 3053424 ~ 3059091 (+) True XLOC_009625
TCONS_00021672 lncRNA downstream 406669 3136158 ~ 3137243 (+) True XLOC_009627
TCONS_00021675 lncRNA downstream 417773 3147262 ~ 3149776 (+) False XLOC_009628
TCONS_00021674 lncRNA downstream 417773 3147262 ~ 3149776 (+) False XLOC_009628
TCONS_00021673 lncRNA downstream 417773 3147262 ~ 3149776 (+) False XLOC_009628
TCONS_00019313 mRNA upstream 146095 2565433 ~ 2583278 (+) False XLOC_009619
TCONS_00019312 mRNA upstream 146095 2565433 ~ 2583278 (+) True XLOC_009619
TCONS_00019311 mRNA upstream 256796 2469889 ~ 2472577 (+) True XLOC_009618
TCONS_00019310 mRNA upstream 294911 2433696 ~ 2434462 (+) True XLOC_009617
TCONS_00019307 mRNA upstream 623817 1802307 ~ 2105556 (+) False XLOC_009613
TCONS_00019316 mRNA downstream 90851 2820340 ~ 2833536 (+) False XLOC_009621
TCONS_00019315 mRNA downstream 90851 2820340 ~ 2833536 (+) False XLOC_009621
TCONS_00019317 mRNA downstream 90873 2820362 ~ 2833398 (+) True XLOC_009621
TCONS_00019318 mRNA downstream 111286 2840775 ~ 2844058 (+) False XLOC_009622
TCONS_00019319 mRNA downstream 113939 2843428 ~ 2844195 (+) True XLOC_009622
TCONS_00019309 other upstream 445199 2284056 ~ 2284174 (+) True XLOC_009616
TCONS_00019306 other upstream 988315 1740937 ~ 1741058 (+) True XLOC_009612
TCONS_00019299 other upstream 1508811 1220446 ~ 1220562 (+) True XLOC_009606
TCONS_00019298 other upstream 1516585 1212674 ~ 1212788 (+) True XLOC_009605
TCONS_00019326 other downstream 624012 3353501 ~ 3353617 (+) True XLOC_009631
TCONS_00019348 other downstream 1968324 4697813 ~ 4707300 (+) False XLOC_009649
TCONS_00019354 other downstream 2040890 4770379 ~ 4779952 (+) False XLOC_009652
TCONS_00019355 other downstream 2044644 4774133 ~ 4776956 (+) True XLOC_009652
TCONS_00019358 other downstream 2144875 4874364 ~ 4874481 (+) True XLOC_009654

Expression Profile

//