RNA id: TCONS_00019358


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00019358
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_009654
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 4874364 ~ 4874481 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tttttctgctaTTGATAACAAtgagccggcagctagctctctgcaactctcacatggtcgcccacccggtcagtacctggatgggagacctcatgggaaagctaggttgctgatggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120951

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021878 lncRNA upstream 162636 4708735 ~ 4711728 (+) False XLOC_009650
TCONS_00021879 lncRNA upstream 162636 4708822 ~ 4711728 (+) True XLOC_009650
TCONS_00019349 lncRNA upstream 166696 4706841 ~ 4707668 (+) True XLOC_009649
TCONS_00021877 lncRNA upstream 314452 4559111 ~ 4559912 (+) True XLOC_009647
TCONS_00021876 lncRNA upstream 447070 4422621 ~ 4427294 (+) True XLOC_009644
TCONS_00019372 lncRNA downstream 621691 5496172 ~ 5496763 (+) True XLOC_009658
TCONS_00021681 lncRNA downstream 624793 5499274 ~ 5502699 (+) True XLOC_009659
TCONS_00021880 lncRNA downstream 1520822 6395303 ~ 6421449 (+) False XLOC_009668
TCONS_00021881 lncRNA downstream 1520823 6395304 ~ 6412819 (+) False XLOC_009668
TCONS_00021882 lncRNA downstream 1527110 6401591 ~ 6412819 (+) True XLOC_009668
TCONS_00019357 mRNA upstream 7976 4839078 ~ 4866388 (+) True XLOC_009653
TCONS_00019353 mRNA upstream 77799 4770266 ~ 4796565 (+) False XLOC_009652
TCONS_00019351 mRNA upstream 127872 4725829 ~ 4746492 (+) False XLOC_009651
TCONS_00019350 mRNA upstream 135018 4725829 ~ 4739346 (+) False XLOC_009651
TCONS_00019352 mRNA upstream 139081 4725848 ~ 4735283 (+) True XLOC_009651
TCONS_00019359 mRNA downstream 33209 4907690 ~ 4913970 (+) True XLOC_009655
TCONS_00019360 mRNA downstream 281939 5156420 ~ 5167280 (+) True XLOC_009656
TCONS_00019361 mRNA downstream 309921 5184402 ~ 5199333 (+) False XLOC_009657
TCONS_00019363 mRNA downstream 321745 5196226 ~ 5230611 (+) False XLOC_009657
TCONS_00019364 mRNA downstream 327561 5202042 ~ 5231397 (+) True XLOC_009657
TCONS_00019354 other upstream 94412 4770379 ~ 4779952 (+) False XLOC_009652
TCONS_00019355 other upstream 97408 4774133 ~ 4776956 (+) True XLOC_009652
TCONS_00019348 other upstream 167064 4697813 ~ 4707300 (+) False XLOC_009649
TCONS_00019326 other upstream 1520747 3353501 ~ 3353617 (+) True XLOC_009631
TCONS_00019314 other upstream 2144875 2729373 ~ 2729489 (+) True XLOC_009620
TCONS_00019362 other downstream 309921 5184402 ~ 5231397 (+) False XLOC_009657
TCONS_00019367 other downstream 402195 5276676 ~ 5446774 (+) False XLOC_009658
TCONS_00019368 other downstream 507901 5382382 ~ 5440055 (+) False XLOC_009658
TCONS_00019369 other downstream 534170 5408651 ~ 5436774 (+) False XLOC_009658
TCONS_00019392 other downstream 1856025 6730506 ~ 6733636 (+) False XLOC_009670