RNA id: TCONS_00019438



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00019438
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_009699
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 9237132 ~ 9237246 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccggcagctagctctctgcaacactcacatggtcgcccactgaagctaagtagggctgagcccggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctgggttgTTGCCGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181158

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021888 lncRNA upstream 270206 8966209 ~ 8966926 (+) True XLOC_009697
TCONS_00021887 lncRNA upstream 271293 8964889 ~ 8965839 (+) True XLOC_009696
TCONS_00021886 lncRNA upstream 864562 8355479 ~ 8372570 (+) True XLOC_009691
TCONS_00021885 lncRNA upstream 1443364 7792721 ~ 7793768 (+) True XLOC_009688
TCONS_00019412 lncRNA upstream 1671037 7564527 ~ 7566095 (+) True XLOC_009682
TCONS_00021889 lncRNA downstream 267127 9504373 ~ 9505519 (+) True XLOC_009702
TCONS_00021683 lncRNA downstream 278080 9515326 ~ 9515807 (+) True XLOC_009703
TCONS_00021890 lncRNA downstream 288834 9526080 ~ 9528221 (+) False XLOC_009704
TCONS_00021891 lncRNA downstream 288861 9526107 ~ 9528306 (+) True XLOC_009704
TCONS_00019448 lncRNA downstream 480535 9717781 ~ 9722138 (+) True XLOC_009708
TCONS_00019437 mRNA upstream 29049 9178061 ~ 9208083 (+) True XLOC_009698
TCONS_00019435 mRNA upstream 511329 8716800 ~ 8725803 (+) False XLOC_009695
TCONS_00019434 mRNA upstream 511329 8716800 ~ 8725803 (+) True XLOC_009695
TCONS_00019433 mRNA upstream 536032 8695595 ~ 8701100 (+) True XLOC_009694
TCONS_00019431 mRNA upstream 555954 8673636 ~ 8681178 (+) False XLOC_009693
TCONS_00019439 mRNA downstream 163415 9400661 ~ 9420358 (+) True XLOC_009700
TCONS_00019440 mRNA downstream 258337 9495583 ~ 9497139 (+) False XLOC_009701
TCONS_00019441 mRNA downstream 258344 9495590 ~ 9502154 (+) True XLOC_009701
TCONS_00019444 mRNA downstream 302787 9540033 ~ 9558103 (+) False XLOC_009705
TCONS_00019445 mRNA downstream 343453 9580699 ~ 9606284 (+) True XLOC_009706
TCONS_00019392 other upstream 2503496 6730506 ~ 6733636 (+) False XLOC_009670
TCONS_00019367 other upstream 3790358 5276676 ~ 5446774 (+) False XLOC_009658
TCONS_00019368 other upstream 3797077 5382382 ~ 5440055 (+) False XLOC_009658
TCONS_00019369 other upstream 3800358 5408651 ~ 5436774 (+) False XLOC_009658
TCONS_00019362 other upstream 4005735 5184402 ~ 5231397 (+) False XLOC_009657
TCONS_00019442 other downstream 288861 9526107 ~ 9527209 (+) False XLOC_009704
TCONS_00019443 other downstream 302787 9540033 ~ 9558103 (+) True XLOC_009705
TCONS_00019455 other downstream 1047012 10284258 ~ 10292937 (+) True XLOC_009713
TCONS_00019457 other downstream 1087303 10324549 ~ 10324665 (+) True XLOC_009715
TCONS_00019473 other downstream 1603918 10841164 ~ 10856409 (+) False XLOC_009727

Expression Profile


//