RNA id: TCONS_00019457



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00019457
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_009715
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 10324549 ~ 10324665 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TATCATAGCCATATCTACCTGCTgctcaagaccggttactcactgaagctaagcaaggctgggcctggtcagtacctggatgggagacccaatgggaaaactaggtttctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176771

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021892 lncRNA upstream 307836 10012335 ~ 10016713 (+) False XLOC_009712
TCONS_00021893 lncRNA upstream 307836 10013039 ~ 10016713 (+) True XLOC_009712
TCONS_00019448 lncRNA upstream 602411 9717781 ~ 9722138 (+) True XLOC_009708
TCONS_00021891 lncRNA upstream 796243 9526107 ~ 9528306 (+) True XLOC_009704
TCONS_00021890 lncRNA upstream 796328 9526080 ~ 9528221 (+) False XLOC_009704
TCONS_00021894 lncRNA downstream 53666 10378331 ~ 10379821 (+) True XLOC_009718
TCONS_00019461 lncRNA downstream 63054 10387719 ~ 10389787 (+) True XLOC_009719
TCONS_00021684 lncRNA downstream 292689 10617354 ~ 10617686 (+) True XLOC_009724
TCONS_00019471 lncRNA downstream 488131 10812796 ~ 10813628 (+) True XLOC_009726
TCONS_00019474 lncRNA downstream 533570 10858235 ~ 10859866 (+) False XLOC_009727
TCONS_00019453 mRNA upstream 39675 10264286 ~ 10284874 (+) False XLOC_009713
TCONS_00019454 mRNA upstream 40087 10264601 ~ 10284462 (+) False XLOC_009713
TCONS_00019452 mRNA upstream 538290 9779680 ~ 9786259 (+) True XLOC_009711
TCONS_00019451 mRNA upstream 546621 9762261 ~ 9777928 (+) True XLOC_009710
TCONS_00019449 mRNA upstream 562576 9726038 ~ 9761973 (+) False XLOC_009709
TCONS_00019458 mRNA downstream 5036 10329701 ~ 10342612 (+) False XLOC_009716
TCONS_00019459 mRNA downstream 5513 10330178 ~ 10345769 (+) True XLOC_009716
TCONS_00019460 mRNA downstream 21612 10346277 ~ 10369298 (+) True XLOC_009717
TCONS_00019462 mRNA downstream 88886 10413551 ~ 10422490 (+) False XLOC_009720
TCONS_00019463 mRNA downstream 88889 10413554 ~ 10422488 (+) True XLOC_009720
TCONS_00019455 other upstream 31612 10284258 ~ 10292937 (+) True XLOC_009713
TCONS_00019443 other upstream 766446 9540033 ~ 9558103 (+) True XLOC_009705
TCONS_00019442 other upstream 797340 9526107 ~ 9527209 (+) False XLOC_009704
TCONS_00019438 other upstream 1087303 9237132 ~ 9237246 (+) True XLOC_009699
TCONS_00019392 other upstream 3590913 6730506 ~ 6733636 (+) False XLOC_009670
TCONS_00019473 other downstream 516499 10841164 ~ 10856409 (+) False XLOC_009727
TCONS_00019483 other downstream 917895 11242560 ~ 11290883 (+) False XLOC_009731
TCONS_00019500 other downstream 1375981 11700646 ~ 11703337 (+) False XLOC_009744
TCONS_00019511 other downstream 1916825 12241490 ~ 12245896 (+) False XLOC_009752
TCONS_00019517 other downstream 1975504 12300169 ~ 12300286 (+) True XLOC_009755

Expression Profile


//