RNA id: TCONS_00019518


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00019518
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_009756
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 12380730 ~ 12380846 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TAACATAGCtctagctctctgcaactgtcACATGGTCGCCCACCGAAGATAAGCAGGGTTGCGCtcggtcagtatctggatgggggaccacatgggaaagcaaggttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176725

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00019512 lncRNA upstream 134606 12243583 ~ 12246124 (+) True XLOC_009752
TCONS_00021898 lncRNA upstream 241394 12117631 ~ 12139336 (+) True XLOC_009751
TCONS_00021897 lncRNA upstream 262204 12117631 ~ 12118526 (+) False XLOC_009751
TCONS_00019501 lncRNA upstream 671232 11708510 ~ 11709498 (+) True XLOC_009744
TCONS_00021687 lncRNA upstream 796852 11580652 ~ 11583878 (+) True XLOC_009737
TCONS_00019528 lncRNA downstream 360066 12740912 ~ 12744284 (+) False XLOC_009761
TCONS_00019529 lncRNA downstream 366372 12747218 ~ 12748918 (+) True XLOC_009761
TCONS_00021899 lncRNA downstream 582114 12962960 ~ 12963877 (+) True XLOC_009764
TCONS_00021688 lncRNA downstream 731418 13112264 ~ 13115609 (+) True XLOC_009765
TCONS_00021900 lncRNA downstream 788026 13168872 ~ 13172698 (+) True XLOC_009766
TCONS_00019516 mRNA upstream 86262 12286148 ~ 12294468 (+) True XLOC_009754
TCONS_00019515 mRNA upstream 86267 12281032 ~ 12294463 (+) False XLOC_009754
TCONS_00019514 mRNA upstream 104505 12267672 ~ 12276225 (+) True XLOC_009753
TCONS_00019513 mRNA upstream 104534 12265158 ~ 12276196 (+) False XLOC_009753
TCONS_00019510 mRNA upstream 125736 12240605 ~ 12254994 (+) False XLOC_009752
TCONS_00019519 mRNA downstream 136689 12517535 ~ 12560722 (+) False XLOC_009757
TCONS_00019520 mRNA downstream 141026 12521872 ~ 12560342 (+) True XLOC_009757
TCONS_00019521 mRNA downstream 230516 12611362 ~ 12617155 (+) True XLOC_009758
TCONS_00019523 mRNA downstream 251582 12632428 ~ 12639753 (+) False XLOC_009759
TCONS_00019522 mRNA downstream 251582 12632428 ~ 12639753 (+) True XLOC_009759
TCONS_00019517 other upstream 80444 12300169 ~ 12300286 (+) True XLOC_009755
TCONS_00019511 other upstream 134834 12241490 ~ 12245896 (+) False XLOC_009752
TCONS_00019500 other upstream 677393 11700646 ~ 11703337 (+) False XLOC_009744
TCONS_00019483 other upstream 1089847 11242560 ~ 11290883 (+) False XLOC_009731
TCONS_00019473 other upstream 1524321 10841164 ~ 10856409 (+) False XLOC_009727
TCONS_00019534 other downstream 1043702 13424548 ~ 13441633 (+) False XLOC_009767
TCONS_00019535 other downstream 1043705 13424551 ~ 13441595 (+) False XLOC_009767
TCONS_00019585 other downstream 3485378 15866224 ~ 15867165 (+) True XLOC_009800
TCONS_00019587 other downstream 3773478 16154324 ~ 16154458 (+) True XLOC_009803
TCONS_00019609 other downstream 5136102 17516948 ~ 17517082 (+) True XLOC_009816