RNA id: TCONS_00019587



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00019587
length 135
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_009803
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 16154324 ~ 16154458 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATTGTTAGCCTATGCCTTTTTATAACAACTTAACAGAGTttactctcacatggtcgcccactgaagctaagaagggctgtgcccggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119946

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00019586 lncRNA upstream 94516 16055484 ~ 16059808 (+) True XLOC_009802
TCONS_00021907 lncRNA upstream 153582 15999747 ~ 16000742 (+) True XLOC_009801
TCONS_00019584 lncRNA upstream 444241 15709411 ~ 15710083 (+) True XLOC_009799
TCONS_00021906 lncRNA upstream 783063 15369692 ~ 15371261 (+) True XLOC_009798
TCONS_00021698 lncRNA upstream 822177 15331862 ~ 15332147 (+) True XLOC_009797
TCONS_00021908 lncRNA downstream 490221 16644679 ~ 16648875 (+) True XLOC_009806
TCONS_00021699 lncRNA downstream 553693 16708151 ~ 16714418 (+) True XLOC_009807
TCONS_00019598 lncRNA downstream 778589 16933047 ~ 16935466 (+) True XLOC_009809
TCONS_00021909 lncRNA downstream 849556 17004014 ~ 17004375 (+) True XLOC_009811
TCONS_00021910 lncRNA downstream 1145695 17300153 ~ 17302519 (+) True XLOC_009814
TCONS_00019581 mRNA upstream 1007096 15097763 ~ 15147228 (+) False XLOC_009796
TCONS_00019582 mRNA upstream 1007319 15097854 ~ 15147005 (+) False XLOC_009796
TCONS_00019583 mRNA upstream 1025162 15114645 ~ 15129162 (+) False XLOC_009796
TCONS_00019580 mRNA upstream 1103482 14812585 ~ 15050842 (+) True XLOC_009794
TCONS_00019579 mRNA upstream 1105799 14710436 ~ 15048525 (+) False XLOC_009794
TCONS_00019588 mRNA downstream 99252 16253710 ~ 16303451 (+) False XLOC_009804
TCONS_00019589 mRNA downstream 110652 16265110 ~ 16304147 (+) False XLOC_009804
TCONS_00019590 mRNA downstream 111392 16265850 ~ 16304147 (+) False XLOC_009804
TCONS_00019591 mRNA downstream 111970 16266428 ~ 16304147 (+) True XLOC_009804
TCONS_00019592 mRNA downstream 375290 16529748 ~ 16554130 (+) True XLOC_009805
TCONS_00019585 other upstream 287159 15866224 ~ 15867165 (+) True XLOC_009800
TCONS_00019534 other upstream 2712691 13424548 ~ 13441633 (+) False XLOC_009767
TCONS_00019535 other upstream 2712729 13424551 ~ 13441595 (+) False XLOC_009767
TCONS_00019518 other upstream 3773478 12380730 ~ 12380846 (+) True XLOC_009756
TCONS_00019517 other upstream 3854038 12300169 ~ 12300286 (+) True XLOC_009755
TCONS_00019609 other downstream 1362490 17516948 ~ 17517082 (+) True XLOC_009816
TCONS_00019610 other downstream 1416352 17570810 ~ 17570934 (+) True XLOC_009818
TCONS_00019630 other downstream 2910887 19065345 ~ 19128471 (+) False XLOC_009830
TCONS_00019642 other downstream 3549966 19704424 ~ 19704538 (+) True XLOC_009838
TCONS_00019651 other downstream 4013376 20167834 ~ 20170828 (+) True XLOC_009843