RNA id: TCONS_00019672


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00019672
length 309
RNA type mRNA
GC content 0.32
exon number 17
gene id XLOC_009858
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 21016820 ~ 21055136 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GTTAAAAgaaagtttaaaaaCTTTGTTTGGTTagacagaaaaatgaaaagaaaaaagaaaatgctattgtatatacctaaattgcccactcaaaactcattttatgatttgaataacaataaaaaaaGGGGCAGGCGATTAGAGGGCCTCAGGAAGTTTAGGGAATTtgtgtgtttttctgtggtgCTTTTAAAGCCCATttgtatacatatatttttgAAATCTGAATTGTCAGTACAAATGTTACAGGCTTGTGCTGAATtaaataCAAGGATCACTTTCAGCAGAGCATTACACTCATTTTCCTCC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000191861

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00019662 lncRNA upstream 129396 20871044 ~ 20887424 (+) False XLOC_009850
TCONS_00019660 lncRNA upstream 136615 20871015 ~ 20880205 (+) False XLOC_009850
TCONS_00019663 lncRNA upstream 142320 20873723 ~ 20874500 (+) True XLOC_009850
TCONS_00021920 lncRNA upstream 321303 20684940 ~ 20695517 (+) False XLOC_009848
TCONS_00021708 lncRNA upstream 321303 20688916 ~ 20695517 (+) True XLOC_009848
TCONS_00021921 lncRNA downstream 85912 21141048 ~ 21142516 (+) True XLOC_009859
TCONS_00021922 lncRNA downstream 579251 21634387 ~ 21634836 (+) True XLOC_009862
TCONS_00019681 lncRNA downstream 643859 21698995 ~ 21703320 (+) False XLOC_009863
TCONS_00019683 lncRNA downstream 643953 21699089 ~ 21703817 (+) False XLOC_009863
TCONS_00019684 lncRNA downstream 643959 21699095 ~ 21703511 (+) False XLOC_009863
TCONS_00019671 mRNA upstream 39114 20947439 ~ 20977706 (+) True XLOC_009857
TCONS_00019670 mRNA upstream 39119 20934353 ~ 20977701 (+) False XLOC_009857
TCONS_00019669 mRNA upstream 87637 20926673 ~ 20929183 (+) True XLOC_009856
TCONS_00019668 mRNA upstream 99236 20915319 ~ 20917584 (+) True XLOC_009855
TCONS_00019666 mRNA upstream 103817 20910186 ~ 20913003 (+) True XLOC_009853
TCONS_00019673 mRNA downstream 187355 21242491 ~ 21418655 (+) False XLOC_009860
TCONS_00019675 mRNA downstream 275498 21330634 ~ 21418775 (+) False XLOC_009860
TCONS_00019674 mRNA downstream 275498 21330634 ~ 21418775 (+) True XLOC_009860
TCONS_00019676 mRNA downstream 369978 21425114 ~ 21441226 (+) False XLOC_009861
TCONS_00019677 mRNA downstream 370003 21425139 ~ 21429214 (+) False XLOC_009861
TCONS_00019667 other upstream 103336 20913413 ~ 20913484 (+) True XLOC_009854
TCONS_00019658 other upstream 511955 20496773 ~ 20504865 (+) True XLOC_009846
TCONS_00019655 other upstream 712545 20296823 ~ 20304275 (+) True XLOC_009845
TCONS_00019651 other upstream 845992 20167834 ~ 20170828 (+) True XLOC_009843
TCONS_00019642 other upstream 1312282 19704424 ~ 19704538 (+) True XLOC_009838
TCONS_00019682 other downstream 643870 21699006 ~ 21703679 (+) False XLOC_009863
TCONS_00019718 other downstream 2342665 23397801 ~ 23399160 (+) False XLOC_009882
TCONS_00019728 other downstream 2552095 23607231 ~ 23607352 (+) True XLOC_009889
TCONS_00019735 other downstream 2782784 23837920 ~ 23854611 (+) False XLOC_009892
TCONS_00019751 other downstream 2905735 23960871 ~ 23962929 (+) False XLOC_009898