RNA id: TU501522


Basic Information

Item Value
RNA id TU501522
length 2431
lncRNA type sense_over
GC content 0.37
exon number 2
gene id G436949
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000306
NCBI id null
chromosome length 11491657
location 10775060 ~ 10802813 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU501561 lncRNA upstream 11065 10763648 ~ 10763995 (+) True G436978
TU501558 lncRNA upstream 30236 10741924 ~ 10744824 (+) True G436976
TU501553 lncRNA upstream 34013 10737449 ~ 10737522 (+) False G436975
TU501554 lncRNA upstream 34984 10737449 ~ 10737522 (+) False G436975
TU501552 lncRNA upstream 35191 10737449 ~ 10737522 (+) False G436975
TU501523 lncRNA downstream 4251 10807064 ~ 10826963 (+) True CI01000306_10775550_10815981
TU501531 lncRNA downstream 78294 10881107 ~ 10901365 (+) True G436958
TU501534 lncRNA downstream 169160 10978441 ~ 10990359 (+) True G436961
TU501533 lncRNA downstream 187682 10990495 ~ 10998454 (+) True G436960
TU501566 lncRNA downstream 208911 11011724 ~ 11011998 (+) True G436983
CI01000306_10751001_10756733.mRNA mRNA upstream 18285 10750610 ~ 10756775 (+) True CI01000306_10751001_10756733
CI01000306_10738169_10739341.mRNA mRNA upstream 35171 10738169 ~ 10739889 (+) False CI01000306_10738169_10739341
CI01000306_10564069_10568262.mRNA mRNA upstream 206503 10562840 ~ 10568557 (+) True CI01000306_10564069_10568262
CI01000306_10548464_10549530.mRNA mRNA upstream 225433 10548464 ~ 10549627 (+) True CI01000306_10548464_10549530
CI01000306_10429251_10466444.mRNA mRNA upstream 308209 10429251 ~ 10466851 (+) True CI01000306_10429251_10466444
CI01000306_10975455_10976511.mRNA mRNA downstream 172514 10975327 ~ 10977095 (+) False CI01000306_10975455_10976511
CI01000306_11052174_11076357.mRNA mRNA downstream 249361 11052174 ~ 11076496 (+) True CI01000306_11052174_11076357
CI01000306_11107383_11122980.mRNA mRNA downstream 304486 11107299 ~ 11123375 (+) True CI01000306_11107383_11122980
CI01000306_11139228_11152171.mRNA mRNA downstream 336415 11139228 ~ 11152218 (+) True CI01000306_11139228_11152171
CI01000306_11181222_11192574.mRNA mRNA downstream 378409 11181222 ~ 11192640 (+) True CI01000306_11181222_11192574
TU500080 other upstream 881821 9891990 ~ 9892016 (+) True G435641
TU500075 other upstream 890141 9879920 ~ 9884919 (+) True G435639
TU500059 other upstream 911871 9860480 ~ 9863189 (+) False CI01000306_09860935_09865155
TU501503 other downstream 280175 11082988 ~ 11098033 (+) False G436932
TU501504 other downstream 280175 11082988 ~ 11098376 (+) True G436932
TU501617 other downstream 466945 11269758 ~ 11271160 (+) True G437030

Expression Profile