RNA id: TU501523


Basic Information

Item Value
RNA id TU501523
length 19596
lncRNA type sense_over
GC content 0.39
exon number 2
gene id CI01000306_10775550_10815981
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000306
NCBI id null
chromosome length 11491657
location 10775346 ~ 10826963 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

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TU501568 lncRNA downstream 199163 11026126 ~ 11026492 (+) True G436985
CI01000306_10751001_10756733.mRNA mRNA upstream 50289 10750610 ~ 10756775 (+) True CI01000306_10751001_10756733
CI01000306_10738169_10739341.mRNA mRNA upstream 67175 10738169 ~ 10739889 (+) False CI01000306_10738169_10739341
CI01000306_10564069_10568262.mRNA mRNA upstream 238507 10562840 ~ 10568557 (+) True CI01000306_10564069_10568262
CI01000306_10548464_10549530.mRNA mRNA upstream 257437 10548464 ~ 10549627 (+) True CI01000306_10548464_10549530
CI01000306_10429251_10466444.mRNA mRNA upstream 340213 10429251 ~ 10466851 (+) True CI01000306_10429251_10466444
CI01000306_10975455_10976511.mRNA mRNA downstream 148364 10975327 ~ 10977095 (+) False CI01000306_10975455_10976511
CI01000306_11052174_11076357.mRNA mRNA downstream 225211 11052174 ~ 11076496 (+) True CI01000306_11052174_11076357
CI01000306_11107383_11122980.mRNA mRNA downstream 280336 11107299 ~ 11123375 (+) True CI01000306_11107383_11122980
CI01000306_11139228_11152171.mRNA mRNA downstream 312265 11139228 ~ 11152218 (+) True CI01000306_11139228_11152171
CI01000306_11181222_11192574.mRNA mRNA downstream 354259 11181222 ~ 11192640 (+) True CI01000306_11181222_11192574
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TU501617 other downstream 442795 11269758 ~ 11271160 (+) True G437030

Expression Profile