RNA id: TCONS_00019885


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00019885
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_009989
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 28388046 ~ 28388163 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgccacagccatatgaccctgcagcccaagaccggttatttactgaagctaagcatggCTGAGCCTTGTTCagaacctggatgggagaccgcatggaaaaactaggttgctgttggat

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117909

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021953 lncRNA upstream 116651 28270015 ~ 28271395 (+) False XLOC_009987
TCONS_00021952 lncRNA upstream 338018 28049554 ~ 28050028 (+) True XLOC_009986
TCONS_00021720 lncRNA upstream 514679 27839927 ~ 27873367 (+) True XLOC_009984
TCONS_00019876 lncRNA upstream 816695 27569837 ~ 27571351 (+) True XLOC_009980
TCONS_00021947 lncRNA upstream 831257 27543308 ~ 27556789 (+) False XLOC_009979
TCONS_00021954 lncRNA downstream 272232 28660395 ~ 28667333 (+) False XLOC_009994
TCONS_00021955 lncRNA downstream 272240 28660403 ~ 28663860 (+) True XLOC_009994
TCONS_00019908 lncRNA downstream 637138 29025301 ~ 29029007 (+) False XLOC_010003
TCONS_00019909 lncRNA downstream 637140 29025303 ~ 29025882 (+) True XLOC_010003
TCONS_00021956 lncRNA downstream 823199 29211362 ~ 29227112 (+) False XLOC_010005
TCONS_00019882 mRNA upstream 16716 28270037 ~ 28371330 (+) True XLOC_009987
TCONS_00019881 mRNA upstream 389190 27957808 ~ 27998856 (+) True XLOC_009985
TCONS_00019880 mRNA upstream 765863 27614989 ~ 27622183 (+) True XLOC_009983
TCONS_00019878 mRNA upstream 778874 27603739 ~ 27609172 (+) False XLOC_009982
TCONS_00019879 mRNA upstream 778874 27603748 ~ 27609172 (+) True XLOC_009982
TCONS_00019887 mRNA downstream 158994 28547157 ~ 28574789 (+) False XLOC_009990
TCONS_00019886 mRNA downstream 158994 28547157 ~ 28574789 (+) True XLOC_009990
TCONS_00019888 mRNA downstream 190189 28578352 ~ 28591541 (+) False XLOC_009991
TCONS_00019889 mRNA downstream 190485 28578648 ~ 28579313 (+) True XLOC_009991
TCONS_00019890 mRNA downstream 208392 28596555 ~ 28599328 (+) False XLOC_009992
TCONS_00019873 other upstream 832806 27549842 ~ 27555240 (+) False XLOC_009979
TCONS_00019866 other upstream 832910 27543308 ~ 27555136 (+) False XLOC_009979
TCONS_00019869 other upstream 832944 27543582 ~ 27555102 (+) False XLOC_009979
TCONS_00019867 other upstream 832997 27543497 ~ 27555049 (+) False XLOC_009979
TCONS_00019870 other upstream 837690 27543588 ~ 27550356 (+) False XLOC_009979
TCONS_00019905 other downstream 628773 29016936 ~ 29019138 (+) True XLOC_010002
TCONS_00019912 other downstream 828111 29216274 ~ 29216360 (+) True XLOC_010005
TCONS_00019938 other downstream 1614589 30002752 ~ 30036693 (+) False XLOC_010020
TCONS_00019939 other downstream 1692380 30080543 ~ 30080661 (+) True XLOC_010021
TCONS_00019951 other downstream 2582338 30970501 ~ 30971157 (+) True XLOC_010029