RNA id: TCONS_00020126



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00020126
length 123
RNA type rRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_010148
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 40011869 ~ 40011991 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGTGATAGCCACAACCATATtaacctgcagcccaagactggttactcaatgaagctaagcaaggctgcggctggtcagtacctggataagagaccacatgggaaaactaatTTGCTATTGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000160448

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021741 lncRNA upstream 34481 39972169 ~ 39977388 (+) True XLOC_010147
TCONS_00022003 lncRNA upstream 45494 39962404 ~ 39966375 (+) True XLOC_010146
TCONS_00022002 lncRNA upstream 47170 39952357 ~ 39964699 (+) False XLOC_010146
TCONS_00022001 lncRNA upstream 109929 39857185 ~ 39901940 (+) False XLOC_010145
TCONS_00020124 lncRNA upstream 109929 39858672 ~ 39901940 (+) False XLOC_010145
TCONS_00020130 lncRNA downstream 31718 40043709 ~ 40049273 (+) False XLOC_010150
TCONS_00020131 lncRNA downstream 31804 40043795 ~ 40052553 (+) True XLOC_010150
TCONS_00020132 lncRNA downstream 63554 40075545 ~ 40081187 (+) False XLOC_010151
TCONS_00022004 lncRNA downstream 65320 40077311 ~ 40082056 (+) False XLOC_010151
TCONS_00022005 lncRNA downstream 65523 40077514 ~ 40082056 (+) True XLOC_010151
TCONS_00020123 mRNA upstream 428201 39485608 ~ 39583668 (+) True XLOC_010141
TCONS_00020121 mRNA upstream 625796 39271123 ~ 39386073 (+) False XLOC_010140
TCONS_00020122 mRNA upstream 629301 39271250 ~ 39382568 (+) True XLOC_010140
TCONS_00020120 mRNA upstream 765790 39242339 ~ 39246079 (+) True XLOC_010139
TCONS_00020119 mRNA upstream 778418 39196727 ~ 39233451 (+) True XLOC_010138
TCONS_00020127 mRNA downstream 12892 40024883 ~ 40031779 (+) True XLOC_010149
TCONS_00020128 mRNA downstream 31682 40043673 ~ 40074145 (+) False XLOC_010150
TCONS_00020129 mRNA downstream 31716 40043707 ~ 40074142 (+) False XLOC_010150
TCONS_00020134 mRNA downstream 119535 40131526 ~ 40314090 (+) False XLOC_010153
TCONS_00020137 mRNA downstream 205052 40217043 ~ 40220920 (+) True XLOC_010155
TCONS_00020117 other upstream 853687 39147002 ~ 39158182 (+) False XLOC_010137
TCONS_00020107 other upstream 1615074 38394413 ~ 38396795 (+) True XLOC_010132
TCONS_00020102 other upstream 1659591 38350723 ~ 38352278 (+) False XLOC_010130
TCONS_00020097 other upstream 1712225 38296001 ~ 38299644 (+) True XLOC_010128
TCONS_00020086 other upstream 1990735 38021019 ~ 38021134 (+) True XLOC_010122
TCONS_00020136 other downstream 171752 40183743 ~ 40183859 (+) True XLOC_010154
TCONS_00020139 other downstream 290800 40302791 ~ 40320230 (+) True XLOC_010153
TCONS_00020142 other downstream 334456 40346447 ~ 40347376 (+) False XLOC_010157
TCONS_00020144 other downstream 334604 40346595 ~ 40348954 (+) True XLOC_010157
TCONS_00020150 other downstream 564688 40576679 ~ 40585776 (+) False XLOC_010161