RNA id: TCONS_00020214


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00020214
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_010211
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 44605326 ~ 44605440 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tcacagccatatcaccctgcagcccgagagcagctACTCACTAAAGTttagcagggctgagcctggtcggtacctggatgggagaccacatgggaaaaataggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175738

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00020211 lncRNA upstream 786761 43765979 ~ 43818565 (+) True XLOC_010209
TCONS_00021749 lncRNA upstream 917758 43687153 ~ 43687568 (+) True XLOC_010208
TCONS_00022024 lncRNA upstream 1481090 43119050 ~ 43124236 (+) True XLOC_010201
TCONS_00022019 lncRNA upstream 1557047 43041505 ~ 43048279 (+) False XLOC_010199
TCONS_00022018 lncRNA upstream 1557047 43041505 ~ 43048279 (+) False XLOC_010199
TCONS_00020220 lncRNA downstream 597650 45203090 ~ 45206236 (+) True XLOC_010216
TCONS_00020221 lncRNA downstream 611867 45217307 ~ 45273719 (+) True XLOC_010217
TCONS_00022026 lncRNA downstream 850540 45455980 ~ 45481848 (+) False XLOC_010220
TCONS_00022025 lncRNA downstream 850540 45455980 ~ 45481848 (+) False XLOC_010220
TCONS_00022027 lncRNA downstream 1181602 45787042 ~ 45812324 (+) False XLOC_010225
TCONS_00020213 mRNA upstream 279638 44314097 ~ 44325688 (+) True XLOC_010210
TCONS_00020212 mRNA upstream 279651 44298902 ~ 44325675 (+) False XLOC_010210
TCONS_00020210 mRNA upstream 1192033 43401005 ~ 43413293 (+) True XLOC_010207
TCONS_00020209 mRNA upstream 1212871 43368572 ~ 43392455 (+) True XLOC_010206
TCONS_00020208 mRNA upstream 1254821 43347966 ~ 43350505 (+) True XLOC_010205
TCONS_00020215 mRNA downstream 72862 44678302 ~ 44687969 (+) False XLOC_010212
TCONS_00020218 mRNA downstream 162921 44768361 ~ 44780744 (+) True XLOC_010214
TCONS_00020219 mRNA downstream 300884 44906324 ~ 44917748 (+) True XLOC_010215
TCONS_00020222 mRNA downstream 732223 45337663 ~ 45357518 (+) False XLOC_010218
TCONS_00020223 mRNA downstream 732280 45337720 ~ 45356910 (+) True XLOC_010218
TCONS_00020200 other upstream 1706816 42898429 ~ 42898510 (+) False XLOC_010198
TCONS_00020198 other upstream 1727315 42876446 ~ 42878011 (+) True XLOC_010197
TCONS_00020194 other upstream 1823932 42772712 ~ 42781394 (+) False XLOC_010194
TCONS_00020166 other upstream 3056889 41546763 ~ 41548437 (+) True XLOC_010175
TCONS_00020157 other upstream 3551094 41042310 ~ 41054232 (+) False XLOC_010166
TCONS_00020216 other downstream 77625 44683065 ~ 44687935 (+) True XLOC_010212
TCONS_00020217 other downstream 98932 44704372 ~ 44705154 (+) True XLOC_010213
TCONS_00020228 other downstream 982774 45588214 ~ 45588330 (+) True XLOC_010221
TCONS_00020229 other downstream 1061295 45666735 ~ 45666852 (+) True XLOC_010222
TCONS_00020265 other downstream 2406901 47012341 ~ 47012457 (+) True XLOC_010251