RNA id: TCONS_00020229


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00020229
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_010222
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 45666735 ~ 45666852 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AgctacagccatatcaccctgcagcccaagaccggttactaacttaagctaagcagggctgagtctggtcagtacctggatgggagaccacatgagaaaactaggttgctgttcgATA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000169718

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00022026 lncRNA upstream 184887 45455980 ~ 45481848 (+) False XLOC_010220
TCONS_00022025 lncRNA upstream 184887 45455980 ~ 45481848 (+) False XLOC_010220
TCONS_00020221 lncRNA upstream 393016 45217307 ~ 45273719 (+) True XLOC_010217
TCONS_00020220 lncRNA upstream 460499 45203090 ~ 45206236 (+) True XLOC_010216
TCONS_00020211 lncRNA upstream 1848170 43765979 ~ 43818565 (+) True XLOC_010209
TCONS_00022027 lncRNA downstream 120190 45787042 ~ 45812324 (+) False XLOC_010225
TCONS_00022028 lncRNA downstream 130310 45797162 ~ 45812324 (+) True XLOC_010225
TCONS_00022029 lncRNA downstream 321579 45988431 ~ 45990842 (+) True XLOC_010228
TCONS_00022030 lncRNA downstream 418538 46085390 ~ 46104010 (+) True XLOC_010229
TCONS_00022031 lncRNA downstream 602872 46269724 ~ 46270888 (+) True XLOC_010232
TCONS_00020225 mRNA upstream 222930 45425181 ~ 45443805 (+) True XLOC_010219
TCONS_00020224 mRNA upstream 226092 45424907 ~ 45440643 (+) False XLOC_010219
TCONS_00020222 mRNA upstream 309217 45337663 ~ 45357518 (+) False XLOC_010218
TCONS_00020223 mRNA upstream 309825 45337720 ~ 45356910 (+) True XLOC_010218
TCONS_00020219 mRNA upstream 748987 44906324 ~ 44917748 (+) True XLOC_010215
TCONS_00020230 mRNA downstream 26561 45693413 ~ 45734213 (+) True XLOC_010223
TCONS_00020231 mRNA downstream 72341 45739193 ~ 45778664 (+) False XLOC_010224
TCONS_00020232 mRNA downstream 72425 45739277 ~ 45782607 (+) False XLOC_010224
TCONS_00020233 mRNA downstream 72567 45739419 ~ 45782559 (+) False XLOC_010224
TCONS_00020234 mRNA downstream 79697 45746549 ~ 45778664 (+) True XLOC_010224
TCONS_00020228 other upstream 78405 45588214 ~ 45588330 (+) True XLOC_010221
TCONS_00020217 other upstream 961581 44704372 ~ 44705154 (+) True XLOC_010213
TCONS_00020216 other upstream 978800 44683065 ~ 44687935 (+) True XLOC_010212
TCONS_00020214 other upstream 1061295 44605326 ~ 44605440 (+) True XLOC_010211
TCONS_00020200 other upstream 2768225 42898429 ~ 42898510 (+) False XLOC_010198
TCONS_00020265 other downstream 1345489 47012341 ~ 47012457 (+) True XLOC_010251
TCONS_00020272 other downstream 2356441 48023293 ~ 48023408 (+) True XLOC_010259
TCONS_00020273 other downstream 2491457 48158309 ~ 48158423 (+) True XLOC_010260
TCONS_00020274 other downstream 2590161 48257013 ~ 48257130 (+) True XLOC_010261
TCONS_00020297 other downstream 3880919 49547771 ~ 49547886 (+) True XLOC_010272

Expression Profile

//