RNA id: TCONS_00020473


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00020473
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_010416
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 5870573 ~ 5870689 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

Taaaacagccatatcaccctgcaacccagaactggttactcgctgaagctaagcagggctgagcctggtcagtagctggatgggagaccacatgggaaaactaagttgctgtcggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176359

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00022087 lncRNA downstream 84531 5746308 ~ 5786042 (-) False XLOC_010414
TCONS_00022088 lncRNA downstream 84570 5776049 ~ 5786003 (-) True XLOC_010414
TCONS_00022086 lncRNA downstream 226835 5636286 ~ 5643738 (-) True XLOC_010411
TCONS_00022085 lncRNA downstream 281953 5580715 ~ 5588620 (-) True XLOC_010409
TCONS_00022084 lncRNA downstream 282007 5453180 ~ 5588566 (-) False XLOC_010409
TCONS_00021780 lncRNA upstream 312486 6183175 ~ 6188967 (-) False XLOC_010417
TCONS_00022089 lncRNA upstream 377334 6248023 ~ 6249246 (-) True XLOC_010418
TCONS_00022091 lncRNA upstream 420484 6291173 ~ 6351508 (-) False XLOC_010419
TCONS_00022090 lncRNA upstream 420484 6291173 ~ 6351508 (-) False XLOC_010419
TCONS_00022093 lncRNA upstream 420484 6291173 ~ 6351690 (-) False XLOC_010419
TCONS_00020471 mRNA downstream 25692 5800580 ~ 5844881 (-) False XLOC_010415
TCONS_00020469 mRNA downstream 149187 5717760 ~ 5721386 (-) True XLOC_010413
TCONS_00020468 mRNA downstream 198711 5650495 ~ 5671862 (-) True XLOC_010412
TCONS_00020467 mRNA downstream 258093 5607138 ~ 5612480 (-) True XLOC_010410
TCONS_00020464 mRNA downstream 716541 5145132 ~ 5154032 (-) False XLOC_010407
TCONS_00020474 mRNA upstream 311812 6182501 ~ 6205790 (-) False XLOC_010417
TCONS_00020475 mRNA upstream 312796 6183485 ~ 6198543 (-) True XLOC_010417
TCONS_00020476 mRNA upstream 485771 6356460 ~ 6377672 (-) True XLOC_010420
TCONS_00020477 mRNA upstream 516252 6386941 ~ 6391275 (-) False XLOC_010422
TCONS_00020478 mRNA upstream 524622 6395311 ~ 6424818 (-) False XLOC_010423
TCONS_00020472 other downstream 12592 5821297 ~ 5857981 (-) True XLOC_010415
TCONS_00020459 other downstream 763156 5107298 ~ 5107417 (-) True XLOC_010405
TCONS_00020457 other downstream 808944 5061499 ~ 5061629 (-) True XLOC_010404
TCONS_00020450 other downstream 1151188 4712664 ~ 4719385 (-) True XLOC_010400
TCONS_00020445 other downstream 1250808 4615661 ~ 4619765 (-) False XLOC_010398
TCONS_00020493 other upstream 957863 6828552 ~ 6829635 (-) True XLOC_010430
TCONS_00020500 other upstream 1349303 7219992 ~ 7228279 (-) True XLOC_010432
TCONS_00020506 other upstream 1823192 7693881 ~ 7696211 (-) False XLOC_010438
TCONS_00020507 other upstream 1824105 7694794 ~ 7696216 (-) True XLOC_010438
TCONS_00020521 other upstream 2417082 8287771 ~ 8288447 (-) True XLOC_010447