RNA id: TCONS_00020535


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00020535
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_010455
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 9302079 ~ 9302194 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTCACAGCCATATCACCTTGCAGCCCAAAActggttactcactaaagctaaacAGGGCTGAGCTTGCTCAGTACCTGGctgggaaaccacatgggaaaactaggttgctgttgaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174585

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00022116 lncRNA downstream 622617 8668981 ~ 8679462 (-) True XLOC_010452
TCONS_00022115 lncRNA downstream 736978 8551789 ~ 8565101 (-) True XLOC_010451
TCONS_00020523 lncRNA downstream 998900 8300824 ~ 8303179 (-) True XLOC_010448
TCONS_00021785 lncRNA downstream 1159767 8140712 ~ 8142312 (-) True XLOC_010444
TCONS_00020515 lncRNA downstream 1317178 7968221 ~ 7984901 (-) True XLOC_010442
TCONS_00020539 lncRNA upstream 138827 9441021 ~ 9442003 (-) False XLOC_010457
TCONS_00020541 lncRNA upstream 262309 9564503 ~ 9566371 (-) True XLOC_010458
TCONS_00022117 lncRNA upstream 456982 9759176 ~ 9761753 (-) True XLOC_010461
TCONS_00022118 lncRNA upstream 710791 10012985 ~ 10013605 (-) True XLOC_010466
TCONS_00020554 lncRNA upstream 762732 10064926 ~ 10065880 (-) False XLOC_010468
TCONS_00020532 mRNA downstream 374654 8751815 ~ 8927425 (-) True XLOC_010453
TCONS_00020529 mRNA downstream 638527 8529772 ~ 8663552 (-) False XLOC_010451
TCONS_00020528 mRNA downstream 638527 8529772 ~ 8663552 (-) False XLOC_010451
TCONS_00020527 mRNA downstream 638527 8529772 ~ 8663552 (-) False XLOC_010451
TCONS_00020530 mRNA downstream 638586 8530631 ~ 8663493 (-) False XLOC_010451
TCONS_00020536 mRNA upstream 118808 9421002 ~ 9425451 (-) False XLOC_010456
TCONS_00020537 mRNA upstream 120217 9422411 ~ 9423735 (-) True XLOC_010456
TCONS_00020538 mRNA upstream 131544 9433738 ~ 9453591 (-) False XLOC_010457
TCONS_00020540 mRNA upstream 144726 9446920 ~ 9449712 (-) True XLOC_010457
TCONS_00020542 mRNA upstream 369932 9672126 ~ 9675982 (-) True XLOC_010459
TCONS_00020526 other downstream 823070 8478880 ~ 8479009 (-) True XLOC_010450
TCONS_00020525 other downstream 906520 8372265 ~ 8395559 (-) True XLOC_010449
TCONS_00020521 other downstream 1013632 8287771 ~ 8288447 (-) True XLOC_010447
TCONS_00020507 other downstream 1605863 7694794 ~ 7696216 (-) True XLOC_010438
TCONS_00020506 other downstream 1605868 7693881 ~ 7696211 (-) False XLOC_010438
TCONS_00020559 other upstream 953013 10255207 ~ 10261625 (-) True XLOC_010469
TCONS_00020565 other upstream 1527615 10829809 ~ 10837232 (-) False XLOC_010476
TCONS_00020567 other upstream 1614096 10916290 ~ 10916404 (-) True XLOC_010478
TCONS_00020572 other upstream 2458725 11760919 ~ 11779472 (-) False XLOC_010484
TCONS_00020591 other upstream 2709880 12012074 ~ 12012188 (-) True XLOC_010492