RNA id: TCONS_00020567


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00020567
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_010478
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 10916290 ~ 10916404 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tctggcagctagctctctgcaaatcTCACattgtcgcccactgaagctgagcagggctgagcctgatcagtacctggatgggagaccacatggaaaagctaggttgctgctagtg

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184301

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00022122 lncRNA downstream 56676 10849706 ~ 10859614 (-) True XLOC_010477
TCONS_00022120 lncRNA downstream 486397 10421170 ~ 10429893 (-) True XLOC_010472
TCONS_00022119 lncRNA downstream 486470 10421170 ~ 10429820 (-) False XLOC_010472
TCONS_00022121 lncRNA downstream 487750 10425747 ~ 10428540 (-) True XLOC_010473
TCONS_00020557 lncRNA downstream 708448 10205110 ~ 10207842 (-) False XLOC_010469
TCONS_00022123 lncRNA upstream 1180 10917584 ~ 10919434 (-) True XLOC_010479
TCONS_00022124 lncRNA upstream 63648 10980052 ~ 11011652 (-) True XLOC_010480
TCONS_00021786 lncRNA upstream 318485 11234889 ~ 11241220 (-) True XLOC_010481
TCONS_00020570 lncRNA upstream 521465 11437869 ~ 11538368 (-) False XLOC_010482
TCONS_00022125 lncRNA upstream 614481 11530885 ~ 11538821 (-) True XLOC_010482
TCONS_00020564 mRNA downstream 79045 10828787 ~ 10837245 (-) False XLOC_010476
TCONS_00020566 mRNA downstream 81534 10830672 ~ 10834756 (-) True XLOC_010476
TCONS_00020563 mRNA downstream 368509 10522596 ~ 10547781 (-) True XLOC_010475
TCONS_00020562 mRNA downstream 399320 10477533 ~ 10516970 (-) True XLOC_010474
TCONS_00020561 mRNA downstream 511907 10397440 ~ 10404383 (-) True XLOC_010471
TCONS_00020568 mRNA upstream 310842 11227246 ~ 11241424 (-) False XLOC_010481
TCONS_00020569 mRNA upstream 311542 11227946 ~ 11235572 (-) False XLOC_010481
TCONS_00020571 mRNA upstream 844198 11760602 ~ 11766265 (-) False XLOC_010484
TCONS_00020573 mRNA upstream 856991 11773395 ~ 11778933 (-) False XLOC_010484
TCONS_00020574 mRNA upstream 857442 11773846 ~ 11779661 (-) False XLOC_010484
TCONS_00020565 other downstream 79058 10829809 ~ 10837232 (-) False XLOC_010476
TCONS_00020559 other downstream 654665 10255207 ~ 10261625 (-) True XLOC_010469
TCONS_00020535 other downstream 1614096 9302079 ~ 9302194 (-) True XLOC_010455
TCONS_00020526 other downstream 2437281 8478880 ~ 8479009 (-) True XLOC_010450
TCONS_00020525 other downstream 2520731 8372265 ~ 8395559 (-) True XLOC_010449
TCONS_00020572 other upstream 844515 11760919 ~ 11779472 (-) False XLOC_010484
TCONS_00020591 other upstream 1095670 12012074 ~ 12012188 (-) True XLOC_010492
TCONS_00020603 other upstream 1323003 12239407 ~ 12239460 (-) True XLOC_010497
TCONS_00020604 other upstream 1331458 12247862 ~ 12247920 (-) True XLOC_010498
TCONS_00020605 other upstream 1333864 12250268 ~ 12250323 (-) True XLOC_010499

Expression Profile

//