RNA id: TCONS_00020591


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00020591
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_010492
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 12012074 ~ 12012188 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CCTAgtagccatatcaccctgcagcccaagaccagttactcactgaagctaagcggggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacataggaaaaaCGTTGCTGTTGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117480

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00022129 lncRNA downstream 6990 11992566 ~ 12005084 (-) True XLOC_010491
TCONS_00022128 lncRNA downstream 48995 11961685 ~ 11963079 (-) True XLOC_010489
TCONS_00022127 lncRNA downstream 50581 11960630 ~ 11961493 (-) False XLOC_010489
TCONS_00020576 lncRNA downstream 232630 11775141 ~ 11779444 (-) False XLOC_010484
TCONS_00022126 lncRNA downstream 372602 11597384 ~ 11639472 (-) True XLOC_010483
TCONS_00020593 lncRNA upstream 40118 12052306 ~ 12054234 (-) False XLOC_010493
TCONS_00020617 lncRNA upstream 466509 12478697 ~ 12481849 (-) False XLOC_010505
TCONS_00020619 lncRNA upstream 492741 12504929 ~ 12512576 (-) False XLOC_010506
TCONS_00020621 lncRNA upstream 498998 12511186 ~ 12512593 (-) True XLOC_010506
TCONS_00020622 lncRNA upstream 512544 12524732 ~ 12532027 (-) True XLOC_010507
TCONS_00020590 mRNA downstream 25753 11965371 ~ 11986321 (-) False XLOC_010490
TCONS_00020589 mRNA downstream 25753 11965371 ~ 11986321 (-) True XLOC_010490
TCONS_00020587 mRNA downstream 48270 11960588 ~ 11963804 (-) False XLOC_010489
TCONS_00020588 mRNA downstream 49115 11961685 ~ 11962959 (-) False XLOC_010489
TCONS_00020586 mRNA downstream 50749 11960417 ~ 11961325 (-) False XLOC_010489
TCONS_00020592 mRNA upstream 39822 12052010 ~ 12060488 (-) False XLOC_010493
TCONS_00020594 mRNA upstream 40118 12052306 ~ 12060770 (-) False XLOC_010493
TCONS_00020595 mRNA upstream 40122 12052310 ~ 12060782 (-) True XLOC_010493
TCONS_00020596 mRNA upstream 52388 12064576 ~ 12097394 (-) False XLOC_010494
TCONS_00020597 mRNA upstream 53030 12065218 ~ 12095144 (-) False XLOC_010494
TCONS_00020572 other downstream 232602 11760919 ~ 11779472 (-) False XLOC_010484
TCONS_00020567 other downstream 1095670 10916290 ~ 10916404 (-) True XLOC_010478
TCONS_00020565 other downstream 1174842 10829809 ~ 10837232 (-) False XLOC_010476
TCONS_00020559 other downstream 1750449 10255207 ~ 10261625 (-) True XLOC_010469
TCONS_00020535 other downstream 2709880 9302079 ~ 9302194 (-) True XLOC_010455
TCONS_00020603 other upstream 227219 12239407 ~ 12239460 (-) True XLOC_010497
TCONS_00020604 other upstream 235674 12247862 ~ 12247920 (-) True XLOC_010498
TCONS_00020605 other upstream 238080 12250268 ~ 12250323 (-) True XLOC_010499
TCONS_00020606 other upstream 241227 12253415 ~ 12253471 (-) True XLOC_010500
TCONS_00020613 other upstream 462673 12474861 ~ 12494417 (-) False XLOC_010505