RNA id: TCONS_00020809


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00020809
length 64
RNA type misc_RNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_010626
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 20895112 ~ 20895175 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTTGCATATGAGTTTCACACGGCTGGAGGCCAAGGTCAAGTTGAAAGTTGCAGTCTAGTCAGGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000169010

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00020801 lncRNA downstream 523446 20328038 ~ 20371666 (-) False XLOC_010622
TCONS_00020798 lncRNA downstream 582446 20309370 ~ 20312666 (-) True XLOC_010621
TCONS_00022144 lncRNA downstream 582943 20309370 ~ 20312169 (-) False XLOC_010621
TCONS_00022143 lncRNA downstream 742387 20149577 ~ 20152725 (-) True XLOC_010619
TCONS_00021798 lncRNA downstream 851836 20041866 ~ 20043276 (-) True XLOC_010618
TCONS_00022145 lncRNA upstream 28307 20923482 ~ 20927125 (-) True XLOC_010627
TCONS_00022146 lncRNA upstream 36410 20931585 ~ 20934597 (-) False XLOC_010625
TCONS_00020812 lncRNA upstream 36410 20931585 ~ 20934737 (-) False XLOC_010625
TCONS_00022147 lncRNA upstream 36410 20931585 ~ 20934737 (-) False XLOC_010625
TCONS_00020810 lncRNA upstream 36410 20931585 ~ 20934737 (-) False XLOC_010625
TCONS_00020807 mRNA downstream 24907 20805933 ~ 20870205 (-) False XLOC_010625
TCONS_00020808 mRNA downstream 24969 20805937 ~ 20870143 (-) False XLOC_010625
TCONS_00020805 mRNA downstream 39382 20805322 ~ 20855730 (-) False XLOC_010625
TCONS_00020804 mRNA downstream 187370 20529200 ~ 20707742 (-) True XLOC_010624
TCONS_00020800 mRNA downstream 402313 20318400 ~ 20492799 (-) False XLOC_010622
TCONS_00020814 mRNA upstream 138458 21033633 ~ 21038015 (-) True XLOC_010628
TCONS_00020815 mRNA upstream 143345 21038520 ~ 21047872 (-) False XLOC_010629
TCONS_00020816 mRNA upstream 145079 21040254 ~ 21047483 (-) False XLOC_010629
TCONS_00020818 mRNA upstream 235840 21131015 ~ 21140097 (-) False XLOC_010631
TCONS_00020819 mRNA upstream 235881 21131056 ~ 21140098 (-) True XLOC_010631
TCONS_00020803 other downstream 402416 20402220 ~ 20492696 (-) True XLOC_010622
TCONS_00020802 other downstream 501303 20393693 ~ 20393809 (-) True XLOC_010623
TCONS_00020793 other downstream 924745 19878844 ~ 19970367 (-) True XLOC_010616
TCONS_00020792 other downstream 1012165 19876270 ~ 19882947 (-) False XLOC_010616
TCONS_00020779 other downstream 1470979 19422295 ~ 19424133 (-) True XLOC_010607
TCONS_00020827 other upstream 555980 21451155 ~ 21451284 (-) True XLOC_010635
TCONS_00020829 other upstream 560779 21455954 ~ 21463718 (-) False XLOC_010634
TCONS_00020844 other upstream 912247 21807422 ~ 21808355 (-) True XLOC_010642
TCONS_00020846 other upstream 927559 21822734 ~ 21823249 (-) True XLOC_010645
TCONS_00020856 other upstream 1017740 21912915 ~ 21917325 (-) False XLOC_010651