RNA id: TCONS_00022260


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00022260
length 7010
lncRNA type read_through
GC content 0.35
exon number 4
gene id XLOC_011033
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 46396002 ~ 46459850 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0008286 insulin receptor signaling pathway biological_process
GO:0010243 response to organonitrogen compound biological_process
GO:1901698 response to nitrogen compound biological_process
GO:0030234 enzyme regulator activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00021534 lncRNA downstream 2717 46350228 ~ 46393285 (-) True XLOC_011032
TCONS_00022258 lncRNA downstream 2883 46350228 ~ 46393119 (-) False XLOC_011032
TCONS_00021535 lncRNA downstream 2891 46350228 ~ 46393111 (-) False XLOC_011032
TCONS_00022257 lncRNA downstream 192657 46196125 ~ 46203345 (-) True XLOC_011029
TCONS_00021531 lncRNA downstream 298570 46087489 ~ 46097432 (-) True XLOC_011028
TCONS_00022263 lncRNA upstream 3751 46434901 ~ 46459850 (-) True XLOC_011033
TCONS_00021540 lncRNA upstream 88673 46519823 ~ 46521667 (-) False XLOC_011034
TCONS_00021541 lncRNA upstream 89770 46520920 ~ 46521667 (-) False XLOC_011034
TCONS_00022264 lncRNA upstream 92414 46523564 ~ 46525101 (-) True XLOC_011034
TCONS_00022265 lncRNA upstream 190053 46621203 ~ 46622443 (-) True XLOC_011041
TCONS_00021529 mRNA downstream 478319 45912647 ~ 45917683 (-) False XLOC_011026
TCONS_00021530 mRNA downstream 478680 45914480 ~ 45917322 (-) True XLOC_011026
TCONS_00021528 mRNA downstream 485952 45904153 ~ 45910050 (-) True XLOC_011025
TCONS_00021526 mRNA downstream 541120 45796602 ~ 45854882 (-) False XLOC_011024
TCONS_00021527 mRNA downstream 541120 45797026 ~ 45854882 (-) True XLOC_011024
TCONS_00021537 mRNA upstream 86964 46518114 ~ 46525135 (-) False XLOC_011034
TCONS_00021538 mRNA upstream 87520 46518670 ~ 46525155 (-) False XLOC_011034
TCONS_00021539 mRNA upstream 87610 46518760 ~ 46524842 (-) False XLOC_011034
TCONS_00021542 mRNA upstream 99094 46530244 ~ 46567136 (-) False XLOC_011035
TCONS_00021543 mRNA upstream 122830 46553980 ~ 46558521 (-) False XLOC_011036
TCONS_00021533 other downstream 55345 46340543 ~ 46340657 (-) True XLOC_011031
TCONS_00021532 other downstream 179093 46216808 ~ 46216909 (-) True XLOC_011030
TCONS_00021521 other downstream 1150260 45242381 ~ 45245742 (-) True XLOC_011019
TCONS_00021515 other downstream 1202850 45186673 ~ 45193152 (-) True XLOC_011016
TCONS_00021514 other downstream 1221442 45174446 ~ 45174560 (-) True XLOC_011015
TCONS_00021580 other upstream 1511993 47943143 ~ 47943257 (-) True XLOC_011054
TCONS_00021592 other upstream 3564328 49995478 ~ 49995594 (-) True XLOC_011068
TCONS_00021599 other upstream 4207520 50638670 ~ 50638786 (-) True XLOC_011073
TCONS_00021603 other upstream 4504040 50935190 ~ 50935306 (-) True XLOC_011077
TCONS_00021604 other upstream 4530096 50961246 ~ 50961362 (-) True XLOC_011078