RNA id: TCONS_00022353


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00022353
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_011180
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 2673793 ~ 2673907 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gccgacagctagctctctgcaactctcacatggtcgcccactgaatcCAAGCAGGGCTGCGCGcggtcaatacctggatgggagaccacattggaAAGCTAGGTTGATGccgaag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185243

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024572 lncRNA upstream 62962 2599258 ~ 2610831 (+) False XLOC_011179
TCONS_00024571 lncRNA upstream 62962 2599258 ~ 2610831 (+) False XLOC_011179
TCONS_00024570 lncRNA upstream 62962 2599258 ~ 2610831 (+) True XLOC_011179
TCONS_00022352 lncRNA upstream 118505 2552456 ~ 2555288 (+) True XLOC_011178
TCONS_00024450 lncRNA upstream 183321 2490044 ~ 2490472 (+) True XLOC_011177
TCONS_00024573 lncRNA downstream 22449 2696356 ~ 2698680 (+) True XLOC_011181
TCONS_00024574 lncRNA downstream 113576 2787483 ~ 3006276 (+) False XLOC_011183
TCONS_00024575 lncRNA downstream 113576 2787483 ~ 3024992 (+) True XLOC_011183
TCONS_00024576 lncRNA downstream 504558 3178465 ~ 3184831 (+) True XLOC_011187
TCONS_00024577 lncRNA downstream 1557482 4231389 ~ 4232491 (+) True XLOC_011192
TCONS_00022350 mRNA upstream 118578 2549503 ~ 2555215 (+) False XLOC_011178
TCONS_00022351 mRNA upstream 118667 2552453 ~ 2555126 (+) False XLOC_011178
TCONS_00022348 mRNA upstream 408764 2162916 ~ 2265029 (+) False XLOC_011175
TCONS_00022349 mRNA upstream 408764 2214283 ~ 2265029 (+) True XLOC_011175
TCONS_00022347 mRNA upstream 522809 2130018 ~ 2150984 (+) False XLOC_011174
TCONS_00022354 mRNA downstream 53900 2727807 ~ 2765947 (+) False XLOC_011182
TCONS_00022355 mRNA downstream 60424 2734331 ~ 2765952 (+) True XLOC_011182
TCONS_00022358 mRNA downstream 450222 3124129 ~ 3166898 (+) False XLOC_011186
TCONS_00022359 mRNA downstream 454366 3128273 ~ 3166897 (+) True XLOC_011186
TCONS_00022360 mRNA downstream 705766 3379673 ~ 3570911 (+) False XLOC_011188
TCONS_00022337 other upstream 1174444 1499230 ~ 1499349 (+) False XLOC_011165
TCONS_00022328 other upstream 1836730 836949 ~ 837063 (+) True XLOC_011155
TCONS_00022327 other upstream 1870087 803591 ~ 803706 (+) True XLOC_011154
TCONS_00022320 other upstream 2053116 620561 ~ 620677 (+) True XLOC_011148
TCONS_00022318 other upstream 2177068 496611 ~ 496725 (+) True XLOC_011146
TCONS_00022356 other downstream 254167 2928074 ~ 2928192 (+) True XLOC_011184
TCONS_00022357 other downstream 411742 3085649 ~ 3085765 (+) True XLOC_011185
TCONS_00022375 other downstream 1987012 4660919 ~ 4661043 (+) True XLOC_011201
TCONS_00022376 other downstream 2196496 4870403 ~ 4870522 (+) True XLOC_011202
TCONS_00022422 other downstream 4646135 7320042 ~ 7320165 (+) True XLOC_011231