RNA id: TCONS_00022356


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00022356
length 119
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_011184
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 2928074 ~ 2928192 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tctgacaggtTAAAACGGCTTTCTCAACTCTCACATGGaagctcactgaagctaagcagggctgcgcccggtcagtacctgaatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgcagga

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193373

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024573 lncRNA upstream 229394 2696356 ~ 2698680 (+) True XLOC_011181
TCONS_00024572 lncRNA upstream 317243 2599258 ~ 2610831 (+) False XLOC_011179
TCONS_00024571 lncRNA upstream 317243 2599258 ~ 2610831 (+) False XLOC_011179
TCONS_00024570 lncRNA upstream 317243 2599258 ~ 2610831 (+) True XLOC_011179
TCONS_00022352 lncRNA upstream 372786 2552456 ~ 2555288 (+) True XLOC_011178
TCONS_00024576 lncRNA downstream 250273 3178465 ~ 3184831 (+) True XLOC_011187
TCONS_00024577 lncRNA downstream 1303197 4231389 ~ 4232491 (+) True XLOC_011192
TCONS_00024452 lncRNA downstream 1532558 4460750 ~ 4465558 (+) False XLOC_011197
TCONS_00024451 lncRNA downstream 1532558 4460750 ~ 4465558 (+) True XLOC_011197
TCONS_00024578 lncRNA downstream 1542101 4470293 ~ 4478732 (+) True XLOC_011198
TCONS_00022355 mRNA upstream 162122 2734331 ~ 2765952 (+) True XLOC_011182
TCONS_00022354 mRNA upstream 162127 2727807 ~ 2765947 (+) False XLOC_011182
TCONS_00022350 mRNA upstream 372859 2549503 ~ 2555215 (+) False XLOC_011178
TCONS_00022351 mRNA upstream 372948 2552453 ~ 2555126 (+) False XLOC_011178
TCONS_00022348 mRNA upstream 663045 2162916 ~ 2265029 (+) False XLOC_011175
TCONS_00022358 mRNA downstream 195937 3124129 ~ 3166898 (+) False XLOC_011186
TCONS_00022359 mRNA downstream 200081 3128273 ~ 3166897 (+) True XLOC_011186
TCONS_00022360 mRNA downstream 451481 3379673 ~ 3570911 (+) False XLOC_011188
TCONS_00022361 mRNA downstream 462580 3390772 ~ 3568940 (+) True XLOC_011188
TCONS_00022362 mRNA downstream 1065580 3993772 ~ 4014707 (+) False XLOC_011189
TCONS_00022353 other upstream 254167 2673793 ~ 2673907 (+) True XLOC_011180
TCONS_00022337 other upstream 1428725 1499230 ~ 1499349 (+) False XLOC_011165
TCONS_00022328 other upstream 2091011 836949 ~ 837063 (+) True XLOC_011155
TCONS_00022327 other upstream 2124368 803591 ~ 803706 (+) True XLOC_011154
TCONS_00022320 other upstream 2307397 620561 ~ 620677 (+) True XLOC_011148
TCONS_00022357 other downstream 157457 3085649 ~ 3085765 (+) True XLOC_011185
TCONS_00022375 other downstream 1732727 4660919 ~ 4661043 (+) True XLOC_011201
TCONS_00022376 other downstream 1942211 4870403 ~ 4870522 (+) True XLOC_011202
TCONS_00022422 other downstream 4391850 7320042 ~ 7320165 (+) True XLOC_011231
TCONS_00022433 other downstream 4733016 7661208 ~ 7661324 (+) True XLOC_011238